在 Python 中使用 xclim 读取 NetCDF 文件时出错：“xr”的 NameError

Question

我正在使用 Python 中的 xclim 包来处理 NetCDF 文件中的气候数据。但是，当我尝试读取 NetCDF 文件时，遇到名称错误。以下是导致问题的代码片段：

from xclim.core.calendar import percentile_doy
from xclim.indices import cold_spell_duration_index

path_to_tasmin_file = "/scratch/aez849/CCCS/BIAS_CORR_DAYMET/Merge_Hist_rcp45/K/tmin.hist_rcp45_merged.CanESM2.CRCM5-UQAM.day.NAM-44i.mbcn-Daymet.nc"
tasmin = xr.open_dataset(path_to_tasmin_file).tasmin.isel(lat=0, lon=0)

当我运行上面的代码时，我收到以下错误消息：

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/scratch/aez849/CCCS/azal/lib/python3.10/site-packages/xarray/backends/a                                                                                                                                                             pi.py", line 573, in open_dataset
    backend_ds = backend.open_dataset(
  File "/scratch/aez849/CCCS/azal/lib/python3.10/site-packages/xarray/backends/n                                                                                                                                                             etCDF4_.py", line 603, in open_dataset
    store = NetCDF4DataStore.open(
  File "/scratch/aez849/CCCS/azal/lib/python3.10/site-packages/xarray/backends/n                                                                                                                                                             etCDF4_.py", line 367, in open
    import netCDF4
  File "/scratch/aez849/CCCS/azal/lib/python3.10/site-packages/netCDF4/__init__.                                                                                                                                                             py", line 3, in <module>
    from ._netCDF4 import *
  File "src/netCDF4/_netCDF4.pyx", line 1, in init netCDF4._netCDF4
ModuleNotFoundError: No module named 'mpi4py'

任何有关如何解决此问题的见解或建议将不胜感激。 我在安装“mpi4py”模块时遇到问题。显然，它与我拥有的“XClim”版本不匹配。

Answer 1

xclim

使用

xarray

构建，后者的后端之一是

netcdf4

Python 接口。

从

netcdf4-python/src/netCDF4/_netCDF4.pyx

，我们可以读到：

要使用并行 IO，您的程序必须在 MPI 环境中运行 使用 mpi4py。

因此，您可以在运行代码之前尝试安装

mpi4py

（请参阅此处）。