按名称合并多对列

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我有癌症治疗测量数据框,我想使用合并()成对“合并”。但框架包含 100 多个列,所以我想使用某种函数或循环。

这是我的数据框的样子

我有一个带有治疗名称的向量:

drugs <- c("A", "C", "B", "D")

各列代表药物治疗的多次测量结果。我想将列成对合并:A_1 + A_2 到 A(新列)、B_1 等

此代码有效:

df <- df %>% mutate(A = coalesce(A_1, A_2).

但是框架有 100 多列,所以我想使用某种函数或循环,使用带有药物名称的向量的值。 每种药物都有 2 列,但它们的顺序不正确,所以我不能使用编号,我必须使用列的名称。但是当我将其放入函数中时,它不起作用。

补充一点:我想将结果列(A、B、C)等添加到框架中。

r function loops coalesce
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这里有一个带有

split.default
的选项 - 根据列名称模式将数据拆分为数据块,然后通过循环使用
coalesce
 来使用 
list

library(dplyr)
library(stringr)
library(purrr)
df1 %>% 
 split.default(str_remove(names(.), "\\d+$")) %>%
 map_dfc(~ exec(coalesce, !!!.x))

-输出

# A tibble: 5 × 3
      A     B     C
  <dbl> <dbl> <dbl>
1     1     6     2
2     5     5     1
3     3     3     3
4     1     6     3
5    10     8     5

数据

df1 <- structure(list(A1 = c(1, 5, NA, 1, 10), B1 = c(NA, 5, 3, 6, 8
), C1 = c(2, NA, NA, 3, 5), A2 = c(1, 2, 3, 4, 5), C2 = c(0, 
1, 3, 2, NA), B2 = c(6, NA, 7, NA, NA)), class = c("tbl_df", 
"tbl", "data.frame"), row.names = c(NA, -5L))

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更新了后缀

_ViMIC
_EtMIC

library(tidyverse)

old_df <- tribble(
  ~A_EtMIC, ~B_EtMIC, ~C_EtMIC, ~A_ViMIC, ~C_ViMIC, ~B_ViMIC,
  1, NA, 2, 1, 0, 6,
  5, 5, NA, 2, 1, NA,
  NA, 3, NA, 3, 3, 7,
  1, 6, 3, 4, 2, NA,
  10, 8, 5, 5, NA, NA
) 

new_df <- old_df |> 
  mutate(row = row_number()) |> 
  pivot_longer(-row, names_to = c("prefix", "suffix"), 
               names_pattern = "(.*)_(..MIC)") |> 
  pivot_wider(names_from = suffix, 
              values_from = value) |> 
  mutate(coalesced = coalesce(EtMIC, ViMIC)) |> 
  select(- ends_with("MIC")) |> 
  pivot_wider(names_from = prefix, values_from = coalesced,
              names_glue = "{prefix}_MIC")

both_df <- bind_cols(new_df, old_df)

both_df
#> # A tibble: 5 × 10
#>     row A_MIC B_MIC C_MIC A_EtMIC B_EtMIC C_EtMIC A_ViMIC C_ViMIC B_ViMIC
#>   <int> <dbl> <dbl> <dbl>   <dbl>   <dbl>   <dbl>   <dbl>   <dbl>   <dbl>
#> 1     1     1     6     2       1      NA       2       1       0       6
#> 2     2     5     5     1       5       5      NA       2       1      NA
#> 3     3     3     3     3      NA       3      NA       3       3       7
#> 4     4     1     6     3       1       6       3       4       2      NA
#> 5     5    10     8     5      10       8       5       5      NA      NA

reprex 包于 2022 年 6 月 5 日创建(v2.0.1)

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