是否有一个程序包可以将network（）或igraph（）网络转换为R中兼容的Rgraphviz？

Question

以SNA和igraph软件包中用于分析的格式花费了很多时间来格式化网络。这些与Rgraphviz所需的数据类型之间是否有桥梁？我的意思是说，它保留：源到目标，标签，边缘权重，其他属性，例如颜色，等等。

Answer 1

是的，非常容易，在the igraph documentation中清楚：

write.graph(mygraph, file="filename", format="dot")

Answer 2

我没有找到要在igraph中转换Rgraphviz的任何程序包，但这是不保存文件的一种方法。函数graph::graphAM接收到一个邻接矩阵，可以使用函数igraph从igraph::get.adjacency中获得。

使用这种方法，如果您具有链接到节点或边的任何功能，则需要单独添加它们。

library(tidyverse)

# Create the Data
actors <- data.frame(name=c("Alice", "Bob", "Cecil", "David",
                        "Esmeralda"),
                 age=c(48,33,45,34,21),
                 gender=c("F","M","F","M","F"))
relations <- data.frame(from=c("Bob", "Cecil", "Cecil", "David",
                           "David", "Esmeralda"),
                    to=c("Alice", "Bob", "Alice", "Alice", "Bob", "Alice"),
                    same.dept=c(FALSE,FALSE,TRUE,FALSE,FALSE,TRUE),
                    friendship=c(4,5,5,2,1,1), advice=c(4,5,5,4,2,3))

# Create the igraph object
g <- igraph::graph.data.frame(relations, directed=TRUE, vertices=actors)

# transform igraph object in graph which will be used in Rgraphviz
graph::graphAM(igraph::get.adjacency(g) %>% as.matrix(),
           edgemode = 'directed') %>%
  Rgraphviz::layoutGraph() %>%
  Rgraphviz::renderGraph()