ggplot2：geom_smooth选择观察连接（等同于geom_path（））

Question

我正在使用ggplot2创建海洋的垂直剖面。我的原始数据集创建“尖峰”，以便制作平滑的曲线。我希望使用geom_smooth()。我还希望线条根据观察的顺序（而不是根据x轴）进行。当我使用geom_path()时，它适用于原始绘图，但不适用于生成的geom_smooth()（见下图）。

melteddf = Storfjorden %>% melt(id.vars = "Depth")
ggplot(melteddf, aes(y = Depth, x = value)) + 
  facet_wrap(~ variable, nrow = 1, scales = "free_x") + 
  scale_y_reverse() +
  geom_smooth(span = 0.5,se = FALSE) + 
  geom_path()

因此，有没有办法确保平滑曲线按照观察顺序而不是a轴进行？

我的数据子集：

head(Storfjorden)
      Depth Salinity Temperature Fluorescence
    1  0.72    34.14       3.738         0.01
    2  0.92    34.14       3.738         0.02
    3  1.10    34.13       3.739         0.03
    4  1.80    34.14       3.740         0.06
    5  2.80    34.13       3.739         0.02
    6  3.43    34.14       3.739         0.05

Answer 1

您提供的数据非常少，但我们可以使其工作。

使用一些tidyverse包，我们可以为每个variables提供单独的黄土函数。

我们基本上做的是

1. 通过qazxsw poi（qazxsw poi）对您的数据进行分组。
2. 使用variable为每个组拟合黄土功能。
3. 使用group_by从该黄土模型创建预测，在这种情况下，对于数据范围内的1000个值（对于该do）。

.

augment

现在我们可以在新的variable调用中使用该预测数据：

# Load the packages
library(dplyr)
library(broom)

lo <- melteddf %>% 
  group_by(variable) %>% 
  do(augment(
    loess(value ~ Depth, data = .), 
    newdata = data.frame(Depth = seq(min(.$Depth), max(.$Depth), l = 1000))
  ))

（我将简单的字符向量映射到两条线的颜色以创建图例。）

Result:

geom_path