我收集了三个不同年份的丰度、混合分类群物种的数据，其中数据框的每一行对应于在独特地点观察到的物种。我在特定时间点从树上收集了节肢动物：自上次观察以来的 0.43、1、2、3 周。数据包含这些时间点的缺失类别，但我想看看是否与一个时间点到下一个时间点看到的节肢动物存在某种关系。例如，有一件轶事，我发现蜘蛛有吃一些昆虫的倾向，而每当这种情况发生时，其他物种要么不吃，要么数量比之前的观察时间点要少。有没有一种方法可以模拟社区如何随时间变化？或者是否有一种方法可以在物种时间数据中寻找模式，以解释为什么有些群落显得多样化而另一些群落则不然？我想我需要像随机森林模型这样的东西，并且我的数据必须处于站点级别，也许还需要像距离矩阵之类的东西。任何方向都会非常有帮助！谢谢你，M
我将向您指出这两篇论文：
https://link.springer.com/article/10.1007/s10336-016-1404-9
在评估动物种群调查可用性时解释缺失数据：在白令海与冰相关的海豹中的应用
他们都概述了填充人口数据中缺失值的统计方法。我了解您建议根据已知的蜘蛛数量填写缺失值。这可以通过随机森林或类似的回归模型来完成，但在走这条路之前可能需要探索更强大的统计方法。我还建议创建您当前必须探索数据中的相关性的数据的可视化。
没有提供任何数据或代码，但我无法建议 R 中的解决方案。