在循环中从一个较大的目录中复制文件。

Question

如果问题非常基本，我提前道歉。

我需要将一些文件从一个位置复制到另一个位置。我试图用bash写一个脚本来自动完成这个过程。为了使成一个循环，我使用了一个列表和通配符，因为文件的命名是不一致的。我所拥有的是（请注意'应该是`）。

for subject in cat 'subjects_list.txt' ; do
    cp /input/$subject/*_task/*_task-file.nii /output/$subject/dir1/${subject}_task-file.nii
done

这一切都很好，问题是有时在一个主题目录下有2个名为 "*_task "的目录，每个目录都有一个文件*_task-file.nii。但是，其中一个文件并不完整，但由于通配符的存在，脚本会同时抓取两个文件。我想在我的脚本中添加一种方法来检查是否有多个名为task的目录，如果有，则抓取*_task-file.nii，并丢弃另一个--更大的文件应该意味着文件是完整的）。我知道我可以使用 wc -c $file 来检查文件的大小.但是, 我不知道有什么最简单的方法(我的bash知识很基础)可以在我的脚本中写成只复制大小较大的文件. 然而，我不知道什么是最简单的方法（我的bash知识非常基础），在我的脚本中写下只复制较大的文件。如果有谁能告诉我正确的方向，让我可以写一个脚本，我将非常感激。

谢谢你

Answer 1

什么是最简单的方法（我的bash知识是非常基本的），写在我的脚本中，只复制更大的文件。

• 把文件打印成一个有文件名和大小的列表。stat.
• sort 获取列表中最后一个（或第一个，取决于排序顺序）元素。
• 获取列表中的最后一个（或第一个，取决于排序顺序）元素。tail 或 head
• 提取文件名 cut
• 复制该元素。

沿的东西。

file_with_greatest_size=$(
    stat -c '%s %n' /input/$subject/*_task/*_task-file.nii |
    sort -k1n |
    tail -n1 |
    cut -d' ' -f2-
)
cp "$file_with_greatest_size" /destination

# with xargs it could be just: 
#     | xargs -d'\n' -I{} cp {} /destination
# without a temporary variable

注意：

• 不要用回车键`。使用 $(...) 代替。过时和过时的语法
• 作为一个经验法则，记住总是引用你的变量扩展。
• for i in cat 是一个常见的 反bash中的模式。如何在bash中逐行读取文件。.