编程R / Sweave以获得正确的\ Sexpr输出

问题描述 投票:7回答:5

我在为Sweave编程R时遇到了一些问题,#rstats twitter组经常指向这里,所以我想我会把这个问题提到SO人群中。我是一名分析师 - 而不是程序员 - 所以在我的第一篇文章中轻松一点。

问题在于:我正在起草一份带有R的Sweave调查报告,并希望使用\Sexpr{}报告边际收益。例如,而不是说:

只有14%的受访者表示'X'。

我想写这样的报告:

只有\ Sexpr {p.mean(variable)} $ \%$的受访者表示'X'。

问题是Sweave将\Sexpr{}中表达式的结果转换为字符串,这意味着R中表达式的输出和我文档中出现的输出是不同的。例如,上面我使用函数'p.mean':

p.mean<- function (x) {options(digits=1)  
mmm<-weighted.mean(x, weight=weight, na.rm=T)  
print(100*mmm)  
}

在R中,输出如下所示:

p.mean(variable)
>14

但是当我使用\Sexpr{p.mean(variable)}时,我的文档中会得到一个未连接的字符串(在本例中为13.5857142857143)。我试图在全局环境,函数本身和各种命令中将我的函数输出限制为digits=1。它似乎只包含R打印,而不是表达结果的字符转换,最终打印在LaTeX文件中。

as.character(p.mean(variable))  
>[1] 14  
>[1] "13.5857142857143"  

有没有人知道我可以做什么来限制LaTeX文件中打印的数字,通过重新编程R函数或使用Sweave或\Sexpr{}中的设置?

r latex pdflatex sweave
5个回答
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@KennyTM得到了它。 @David,你应该避免使用options(digits = 1),因为它会影响你的所有计算(它会在之后的每个输出中抑制小数)。因此在应用round()后使用weighted.mean()函数。像这样的东西:

\Sexpr{round(p.mean(x))}

并且不要使用print(),但return()。原因如下:

> set.seed(1234)
> x <- rnorm(100)
> foo <- function(x) {
   res <- mean(x) + 5
   print(res)
}
> foo(x)
[1] 5
> foo(x) + 10
[1] 5
[1] 15

使用return()或只在最后一行输入结果变量:

> bar <- function(x) {
   res <- mean(x) + 5
   return(res)
}
> bar(x) + 10
[1] 15

所以,重写你的功能,并确保使用as.character() ...你有所有的位,现在只是把它们放在一起。

附:

我不确定你的功能如何起作用......我从未在分析中使用过加权平均值。令我困惑的是weight=weight。在功能中多放一个参数会不会更好?坦率地说,我仍然惊讶于你的函数给你正确的结果......可能是因为你在函数定义之前定义了weight变量。 [编辑]如果您没有预定义的weight函数,您将无法获得函数的加权平均值,但“常规”意味着!

我希望这个帮助你!

亲切的问候,亚历山大


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试试'格式':

options(digits=1)

然后:

\Sexpr{format(p.mean(variable))}

您还可以使用'nsmall'参数:

options(digits=3)
...
\Sexpr{format(sqrt(2)-0.41,nsmall=2)}

如果你熟悉C,你也可以试试'sprintf'。


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as.character(round(p.mean(variable)))

?


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sprintf()函数非常适合格式化数字输出。


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siunitx包也可用于格式化sweave中的数字。

Code for Sweave

以下脚本显示了如何使用它来格式化数字,语法适用于Sweave。在序言中,您可以设置默认格式

\sisetup{
round-mode = figures,
round-precision = 3
}

然后在命令\Sexpr{num(pi,round_precision=2)}中覆盖它

\documentclass[a4paper]{article}
\usepackage{siunitx}
\usepackage{Sweave}
\title{siunitx}

\sisetup{
round-mode = figures,
round-precision = 3
}
\begin{document}

\maketitle
<<sanitize_number,echo=FALSE>>=
num <- function(x,round_precision=NULL)
{
  if (is.null(round_precision)) {
    return(sprintf("\\\\num{%s}", x))
  } else {
    return(sprintf("\\\\num[round-precision=%s]{%s}",round_precision, x))
  }
}
@
Examples :\\
round\_precision= 2 gives : \Sexpr{num(pi,round_precision=2)} \\
round\_precision= 4 gives : \Sexpr{num(pi,round_precision=4)}\\
Default formatting gives : \Sexpr{num(pi)}
\end{document}

enter image description here

Code for knitr

默认情况下,在knitr中,当设置选项options(digits = 2)is时,\​​ Sexpr中的数字将被舍入。但是如果你想在不同的地方进行不同的舍入,下面的代码可以工作,它需要进行调整,因为不需要在编织器中的\ Sexpr中双重逃避反义。

num <- function(x,round_precision=NULL)
{
  if (is.null(round_precision)) {
    return(sprintf("\\num{%s}", x))
  } else {
    return(sprintf("\\num[round-precision=%s]{%s}",round_precision, x))
  }
}
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