我想--CHROM标志后运行使用值此命令从1到22,如:
python eigenMT.py --CHROM 1 --QTL SG.cis.eqtls.txt --GEN SG.genotypes.txt --GENPOS SG.gen.positions.txt --PHEPOS SG.phe.positions.txt --OUT SG_Out.txt
我试图让一个bash脚本看起来像这样:
for i in {1..22}
do
python eigenMT.py --CHROM $i --QTL SG.cis.eqtls.txt --GEN SG.genotypes.txt --GENPOS SG.gen.positions.txt --PHEPOS SG.phe.positions.txt --OUT SG_Out.txt
done
但我得到一个空SG_Out.txt文件。
能否请你帮我如何在所有22个值运行这一点,在一个文件中写入输出?
我要指出,如果我运行此一一(无环)它的工作原理。
这可能你想要做什么,而无需创建临时文件
for i in {1..22}
do
python eigenMT.py --CHROM $i --QTL SG.cis.eqtls.txt --GEN SG.genotypes.txt --GENPOS SG.gen.positions.txt --PHEPOS SG.phe.positions.txt | tail -n +2
done > SG_Out.txt