使用 cytoscape 从节点和边缘 csv 文件创建网络

Question

从kaggle获取这些网络文件，我想创建一个网络。使用 Gephi，非常简单。然而，在 Cytoscape 上，我创建了一个空网络，并尝试通过拖放或导入底部来导入边缘和节点文件，但没有添加任何内容！有人以前尝试过这个吗？

Answer 1

在 Cytoscape 中这实际上也很简单——只是有点不同。在 Cytoscape 中，您首先创建网络，不是作为空网络，而是导入边缘文件。使用 File->Import->Network from file 并告诉 Cytoscape 哪一列有您的源节点，哪一列有您的目标节点（在示例中，只有两列，所以非常简单）。然后，您可以使用 File->Import->Table from file 导入有关节点的信息，并选择将节点 id 作为关键列的列。