和弦图中不完整的轴线如何填充？

Question

在[https://www.data-to-viz.com/graph/chord.html]提供的代码的迁移示例数据集中，为什么在某些对象中，轴线不会延伸超过最大值。例如，在东南亚、欧洲和西亚，轴线不完整，但有的却有完整的轴线。

看起来，轴线被链接开始的对象的最大值覆盖，但是，在链接结束或连接其他对象的地方，轴线要么是完整的，要么是部分的。

在另一个例子中，轴线大多不完整。

circlize 中是否有一个参数可以使链接与对象相交的地方具有完整的轴线？或者有没有办法在链接与对象相遇之前缩短轴线？

Answer 1

创建和弦图时，您可以使用

circos.axis()

功能操作轴线。 我检查了迁移示例数据集所附弦图的代码，问题出在

majar.at

部分的

circos.axis()

参数中。

当

seq(from = 0, to = xlim[2], by = ifelse(test = xlim[2]>10, yes = 2, no = 1))

的值大于 10 且为奇数时，

xlim[2]

命令会生成少一个数。

就像这里：

xlim=get.cell.meta.dat("xlim")
xlim[2] = 11
seq(from=0, to=xlim[2], by = ifelse(test = xlim[2]>10, yes = 2, no = 1))
#[1]  0  2  4  6  8 10

您可以在此处看到

seq()

函数生成 0-10 之间的数字，而不是 0-11。这就是轴线小于应有尺寸的原因。您可以修改这部分并得到结果。我建议您在 seq() 函数中使用 by = 1 。这将生成从 0 到 11 的所有点。

seq(from=0, to=11, by=1 )
#[1]  0  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10 11