我有一个函数,我需要创建一个表(tab
,然后更改一个值 - tab.names() == k
的值,其中k
在函数调用中给出。
看看http://dirk.eddelbuettel.com/code/rcpp/Rcpp-quickref.pdf,我希望下面的代码可以工作(用变量名替换"foo"
),但我想这需要元素名称是静态的,而我的不是。我已经尝试过使用which
,但是无法编译(从'char'无效转换为'Rcpp :: traits :: storage_type <16> :: type {aka SEXPREC *}' - 所以我在那里做错了。
#include <RcppArmadillo.h>
#include <algorithm>
//[[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
IntegerVector fun(const arma::vec& assignment, int k) {
// count number of peptides per protein
IntegerVector tab = table(as<IntegerVector>(wrap(assignment)));
CharacterVector all_proteins = tab.names();
char kc = '0' + k;
// what I need a working version of:
tab(kc) = 1; // gets ignored, as does a [] version of the same thing.
// or
tab('0' + k) = 1; // also ignored
int ki = which(all_proteins == kc); // gives me compile errors
// extra credit
// tab.names(k-1) = "-1";
return tab;
}
/*** R
set.seed(23)
x <- rpois(20, 5)
k <- 5
fun(x, k)
# same thing in R:
expected_output <- table(x)
expected_output # before modification
# x
# 3 4 5 6 7 9 10 12
# 2 4 3 3 4 2 1 1
expected_output[as.character(k)] <- 1 # this is what I need help with
expected_output
# x
# 3 4 5 6 7 9 10 12
# 2 4 1 3 4 2 1 1
# extra credit:
names(expected_output)[as.character(k)] <- -1
*/
我还在学习rcpp,更重要的是,还在学习如何阅读手册页并将正确的搜索条件插入google / stackoverflow。我确信这是基本的东西(而且我对更好的方法持开放态度 - 我目前认为就像问题的初始方法而言,就像R程序员一样,而不是C ++程序员。)
(顺便说一句 - 使用arma::vec
用于代码的其他部分,我不是为了简单而显示 - 我发现它在这里没用。我讨论过切换它,但是根据我测试过的原则决定反对它部分,它的工作原理,我想做的最后一件事就是引入一个额外的bug ...)
谢谢!
您可以使用.findName()
方法获取相关的index
:
#include <RcppArmadillo.h>
#include <algorithm>
//[[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
IntegerVector fun(const arma::vec& assignment, int k) {
// count number of peptides per protein
IntegerVector tab = table(as<IntegerVector>(wrap(assignment)));
CharacterVector all_proteins = tab.names();
int index = tab.findName(std::string(1, '0' + k));
tab(index) = 1;
all_proteins(index) = "-1";
tab.names() = all_proteins;
return tab;
}
/*** R
set.seed(23)
x <- rpois(20, 5)
k <- 5
fun(x, k)
*/
输出:
> Rcpp::sourceCpp('table-name.cpp')
> set.seed(23)
> x <- rpois(20, 5)
> k <- 5
> fun(x, k)
3 4 -1 6 7 9 10 12
2 4 1 3 4 2 1 1
你可以编写自己的函数(使用String
而不是char
):
int first_which_equal(const CharacterVector& x, String y) {
int n = x.size();
for (int i = 0; i < n; i++) {
if (x[i] == y) return(i);
}
return -1;
}
此外,似乎tab(kc)
正在将kc
转换为整数表示。