广义相异模型（gdm）的输入格式

Question

我正在使用gdm包，并在formatsitepair命令中使用格式1和4对bioData进行了尝试。但是结果却不同，如下所示：

格式1：按物种分类的矩阵

site-by-species matrix

gdm_input1 <- formatsitepair(bioData = bio1, bioFormat = 1, dist = "jaccard", abundance = FALSE, siteColumn = "site", XColumn = "longitude", YColumn = "latitude", predData = env)

结果1 formatsitepair：

result format 1

格式4：站点距离表

site-distance table

gdm_input4 <- formatsitepair(bioData = bio4, bioFormat = 4, dist = "jaccard", abundance = FALSE, siteColumn = "site", XColumn = "longitude", YColumn = "latitude", predData = env)

结果2 formatsitepair：

它显示与我的输入数据帧相同的数据帧-site-distance table

我不明白为什么这不起作用。

Answer 1

原因是因为格式4不仅要求一个站点具有一个值，而且还要求ech站点与所有其他站点的所有可能的站点对组合！！ >>