按因子手动设置形状

Question

示例数据集：

A <- c('a','b', 'c','d','e')
types <- factor(A)
B <- c(1,2,3,4,5)
C <- c(6,7,8,9,10)
D <- c(1,2,1,2,3)
ABC <- data.frame(B,C,D,types)

library(ggplot2)

ggplot(ABC, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=as.factor(types),label=types, shape=as.factor(types))) +
geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+ scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
scale_shape_manual(values=c(15,18,16,17,19))`

绘制此图，您将有 a-e 的因素，它们具有归因于它们的颜色和形状。

在我的代码中，我使用 scale_shape_manual 来设置形状，它们按顺序定义，即因子的顺序是 a、b、c、d、e，我的值是 15、18、16、17、19，所以 a=15（ a 正方形), b=18 等等等等

我想按因子设置这些形状。我的数据每天都会发生变化，并且因素会以不同的顺序排列，但我总是希望相同的因素具有相同的形状。

所以很明显这段代码不起作用，但类似于：

scale_shape_manual(values=('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19))

如果我也能对颜色做同样的事情会很有帮助。

Answer 1

如果我对你的理解正确，总会有（最多）五个类别“a” - “e”，并且你希望这些类别的形状和颜色在数据集中保持一致。这是一种方式（注意：

gg_color_hue(...)

来自here）：

# set up shapes
shapes <- c(15,18,16,17,19)
names(shapes) <- letters[1:5]

# set up colors
gg_color_hue <- function(n) { # ggplot default colors
  hues = seq(15, 375, length=n+1)
  hcl(h=hues, l=65, c=100)[1:n]
}
colors <- gg_color_hue(5)
names(colors) <- names(shapes)

# original data
ggplot(ABC, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=types,label=types, shape=types)) +
  geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
  scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
  scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+ 
  scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
  scale_shape_manual(values=shapes) + scale_color_manual(values=colors)

#new data
DEF <- data.frame(B,C,D,types=factor(c("a","a","a","d","e")))
ggplot(DEF, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=types,label=types, shape=types)) +
  geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
  scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
  scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+ 
  scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
  scale_shape_manual(values=shapes) + scale_color_manual(values=colors)

Answer 2

我确定这不再与 OP 相关，但我发现这个问题的最佳解决方案比当前发布的更简单，并且几乎写入问题本身。

OP 希望使用类似的东西分配手动定义的形状或颜色
“

scale_shape_manual(values=('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19))

”
只需要将分配作为向量传递，如，

scale_shape_manual(values = c('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19))

如果您想要自动生成的颜色，

jlhoward 的回答会更好。而我在下面提供的脚本需要更少的代码行。用户选择。

A <- c('a','b', 'c','d','e')
types <- factor(A)
B <- c(1,2,3,4,5)
C <- c(6,7,8,9,10)
D <- c(1,2,1,2,3)
ABC <- data.frame(B,C,D,types)

library(ggplot2)

ggplot(ABC, aes(x=B ,y=C ,size=D, colour=as.factor(types),label=types, shape=as.factor(types))) +
geom_point()+geom_text(size=2, hjust=0,colour="black", vjust=0) +
scale_size_area(max_size=20, "D", breaks=c(100,500,1000,3000,5000))  +
scale_x_log10(lim=c(0.05,10),breaks=c(0.1,1,10))+
scale_y_continuous(lim=c(0,30000000)) +
scale_shape_manual(values = c('a'=15, 'b'=18, 'c'=16, 'd'=17, 'e'=19)) +
scale_colour_manual(values = c('a'="tomato", 'b'="yellow4", 'c'="palegreen2", 'd'="deepskyblue1", 'e'="orchid3"))`