在Mac上安装mpi4py

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尝试在 mac 上安装 mpi4py 时出现错误

ERROR: Failed building wheel for mpi4py
Failed to build mpi4py
ERROR: Could not build wheels for mpi4py, which is required to install pyproject.toml-based projects

还有

      #include <mpi.h>
               ^~~~~~~
      1 error generated.
      failure.
      removing: _configtest.c _configtest.o
      error: Cannot compile MPI programs. Check your configuration!!!

我已经看到了一些答案,但没有一个答案似乎在Mac上有效,例如

sudo apt-get install lipopenmpi-dev
结果为
sudo: apt-get: command not found 

python mpi
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要使

mpi4py
正常工作,您需要 MPI 库。在 Debian 风格的 Linux 机器上,这确实可能类似于
sudo apt-get lipopenmpi-dev
,但在 macOS 上则不然。

您可以尝试在Conda环境中安装它。我更喜欢 Homebrew,这通常在只有一个人使用的系统上运行良好(例外情况是当您有多个项目需要冲突的 MPI 版本时,例如版本 3.x、4.x 或 5.0)。 Homebrew 还有大量其他有用的软件包(Conda 也是如此)。

https://brew.sh/ 安装 Homebrew,然后按照说明进行设置。您应该只需要

sudo
一次,即可创建
/opt/homebrew
或您喜欢的
/
中的任何目录(只需远离任何现有的系统目录)。

搜索例如使用

brew search mpi
打开 MPI,然后在找到可能的包名称后使用
brew info open-mpi
(例如,还有
mpich
)。现在安装它:
brew install open-mpi
(不需要 sudo)。 MPI 手册中也显示了这一点:https://docs.open-mpi.org/en/v5.0.x/installing-open-mpi/quickstart.html .

请注意,这将安装 5.0 版本(并随着时间的推移进行更新,只要您运行 Homebrew 更新)。

您可能需要将 mpi4py 指向您的 open-MPI 安装位置。要查找文件,请执行

brew list open-mpi
。你会发现
mpicc
包装纸位于
/opt/homebrew/Cellar/open-mpi/5.0.1/bin/mpicc
(至少我的是);按照MPI4py安装手册,即可运行

env MPICC=/opt/homebrew/Cellar/open-mpi/5.0.1/bin/mpicc python -m pip install mpi4py

这应该适用于常规系统Python,任何手动安装的Python,或者在虚拟环境中,甚至在Conda环境中(尽管在后一种情况下,您显然希望尝试通过Conda安装mpi4py,然后还应该安装自己的 open-mpi 库)。

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