LSF 平台错误：lsb_init：LSF 库调用失败：无法打开文件 lsf.conf

Question

我对 LSF 平台有疑问，我无法理解。

出于脚本编写原因，我需要使用 perl 脚本检查“bjobs”（和其他 b***）正在运行/待处理的作业。

由于某种原因它不起作用，我能够查看以下错误消息：

lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf

谷歌和手册中的一些研究没有给出什么好的结果，我做了一些测试。

我的帐户（最大）是 LSF 管理员。 Root 也是 LSF 管理员。

所以我切换到 root，并尝试启动 bjobs，但使用“sudo –u max”达到最大。请看一下这些命令：

hn[~]=> whoami
max
hn[~]=> bjobs
No unfinished job found
hn[~]=> su
Password: 
[root@hn max]# whoami
root
[root@hn max]# sudo -u max whoami
max
[root@hn max]# bjobs
No unfinished job found
[root@hn max]# sudo -u max bjobs
lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf

我该如何纠正这个问题？

Answer 1

默认情况下，LSF 将在 /etc 中查找 lsf.conf。如果不存在，那么它将在环境变量 LSF_ENVDIR 中的目录中查找。

sudo 可能正在重置您的环境。尝试

sudo -i

或放置

Defaults !env_reset

在你的 sudoers 文件中。

你也可以尝试这样的事情

sudo -u max LSF_ENVDIR=$LSF_ENVDIR LSF_SERVERDIR=$LSF_SERVERDIR bjobs

Answer 2

对于任何围绕 SSH 编写脚本的人，必须在命令行上显式设置上述两个变量，如下所示：

ssh [email protected] 'export LSF_ENVDIR=/path/to/lsf/envdir; export LSF_SERVERDIR=/path/to/lsf/serverdir; bsub ...'

或者在文件

~/.ssh/environment

文件中（前提是sshd配置了

PermitUserEnvironment yes

）。

Answer 3

测试环境：IBM Spectrum LSF 10.1.0.0 build 476021，2017 年 11 月 20 日，“Red Hat Enterprise Linux Server 7.9 (Maipo)”。先执行以下命令：

For csh or tcsh:   
source /lsf_installed_dir/path_to/cshrc.lsf

For sh, ksh, or bash:   
. /lsf_installed_dir/path_to/profile.lsf

然后执行bjobs命令，例如bjobs -V。错误消息类似于，

lsb_init: initenv_:fopen(/etc/lsf.conf) failed, No such file or directory.
lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf

不再显示。