致命错误：运行 AFNI bash shell 时出现非法表达式

Question

我想在shell中运行以下脚本

for i in {1..10};
    do
    3dcalc -a COLUMNS.nii -expr ‘equals(a, "${i}”)’ -prefix col_"${i}”.nii;
    done

但是我收到错误，COLUMN.nii 文件是一个漂亮的文件，其中包含值范围从 1 到 10 的掩码集合，我想在 for 循环中使用此 AFNI 命令将这些掩码分成单独的漂亮文件.

Answer 1

您可能使用文字处理程序（例如 Microsoft Word）编辑了代码，该程序不会将“正常”单引号和双引号字符放入文件中。

在你的程序中

3dcalc -a COLUMNS.nii -expr ‘equals(a, "${i}”)’ -prefix col_"${i}”.nii;

具有那些“卷曲”单引号和双引号字符。将其更改为

3dcalc -a COLUMNS.nii -expr 'equals(a, "${i}")' -prefix col_"${i}".nii;

编辑代码时，我建议您使用特定于编程的编辑器（有很多），而不是文字处理程序。