我的输入:
Position A B C D No
1 0 0 0 0 0
2 1 0 1 0 0
3 0 6 0 0 0
4 0 0 0 0 0
5 0 5 0 0 0
我有一个 TSV 文件,如上面所示,我希望仅对 ABCD 列中的数字行求和,而不是位置列中的数字行。 所需的输出将有一个 TSV,两列,第一行包含位置和总和,
Position Sum
1 0
2 2
3 6
4 0
5 5
到目前为止我已经:
awk 'BEGIN{print"Position\tSum"}{if(NR==1)next; sum=$2+$3+$4+$5 printf"%d\t%d\n",$sum}' infile.tsv > outfile.tsv
你已经非常接近了,试试这个:
awk 'BEGIN{print"Position\tSum"}{if(NR==1)next; sum=$2+$3+$4+$5; printf "%d\t%d\n",$1,sum; }' infile.tsv > outfile.tsv
但我说换行符和空格更干净:
awk '
BEGIN {
print"Position\tSum";
}
{
if (NR==1) {
next;
}
sum = $2 + $3 + $4 + $5 + $6;
printf "%d\t%d\n", $1, sum;
}'
极简主义脚本可以
$ awk '{print $1 "\t" (NR==1?"Sum":$2+$3+$4+$5)}' file
我采用了循环方法,而不是在许多情况下对字段编号进行硬编码。我们跳过第一个字段并取所有剩余字段的总和。
awk 'FNR==1{print $1,"sum";next} {for(i=2;i<NF;i++){sum+=$i};print $1,sum;sum=""}' Input_file
如果需要以TAB形式输出,请将
awk
更改为awk 'BEGIN{OFS="\t"}
(其余代码保持不变)。