在 Windows 上安装 rpy2

Question

我正在尝试在运行 Windows 10 的机器上安装 rpy2。我已经安装了 R 3.4.4（64 位）并且它在 RGui 中运行良好。然后我尝试 pip install rpy2，但出现找不到 R 的错误，因此我将 c:\Program Files\R\R-3.4.4 in\ 添加到我的路径环境变量中。现在当我做

pip install rpy2

我得到一个不同的错误：

Command '('c:\PROGRA~1\R\R-34~1.4 in\x64\R', 'CMD', 'config', '--ldflags')' 返回非零退出状态 1

完整的输出如下。知道我做错了什么吗？

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pip install rpy2

Collecting rpy2
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/88/f7/788e5e1587bc1ab48b5b0467f9c3a08ef5aadbd993ed835559a10e452121/rpy2-2.9.3.tar.gz (193kB)
Complete output from command python setup.py egg_info:
R version 3.4.4 (2018-03-15) -- "Someone to Lean On"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under the terms of the
GNU General Public License versions 2 or 3.
For more information about these matters see
http://www.gnu.org/licenses/.

'sh' is not recognized as an internal or external command,
operable program or batch file.
R version 3.4.4 (2018-03-15) -- "Someone to Lean On"
c:\PROGRA~1\R\R-34~1.4\bin\x64\R CMD config --ldflags
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "C:\Users\py\AppData\Local\Temp\pip-build-qz4rb_4o\rpy2\setup.py", line 374, in <module>
    ri_ext = getRinterface_ext()
  File "C:\Users\py\AppData\Local\Temp\pip-build-qz4rb_4o\rpy2\setup.py", line 269, in getRinterface_ext
    ldf = shlex.split(' '.join(rexec.cmd_config('--ldflags')))
  File "C:\Users\py\AppData\Local\Temp\pip-build-qz4rb_4o\rpy2\setup.py", line 222, in cmd_config
    universal_newlines = True)
  File "c:\users\py\miniconda3\lib\subprocess.py", line 626, in check_output
    **kwargs).stdout
  File "c:\users\py\miniconda3\lib\subprocess.py", line 708, in run
    output=stdout, stderr=stderr)
subprocess.CalledProcessError: Command '('c:\\PROGRA~1\\R\\R-34~1.4\\bin\\x64\\R', 'CMD', 'config', '--ldflags')' returned non-zero exit status 1

----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in C:\Users\py\AppData\Local\Temp\pip-build-qz4rb_4o\rpy2\

Answer 1

输出包含错误：

'sh' 不被识别为内部或外部命令

但我认为这只是一个警告（因为它后面有输出）。
sh (Shell) 是 Nix 特定的，并且（自然地）在 Win 上不存在。但是，如果您为 Win 或 Nix env 模拟器（如 Cygwin、MSYS2，...）安装一个端口，它可能会工作。

这是 [ReadTheDocs.RPy2]：安装（其中有“在 Linux 上编译”和“在 OS X 上编译”部分，但没有关于 Win 的内容，尽管它提到它应该编译成功）状态：

• 目前没有二进制文件或对 Microsoft Windows 的支持（更多是因为缺乏资源）。

• Microsoft 的 Windows - 非官方和不受支持的二进制文件由 Christoph Gohlke (http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs) 提供；目前几乎没有对该平台的支持

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更新#0

添加@pyguy采取的步骤（来自评论），以便成功安装RPy2：

• 从 [UCI.LFD] 下载 rpy2‑2.9.3‑cp35‑cp35m‑win_amd64.whl（或可能同时添加的任何更新版本）：Python 扩展包的非官方 Windows 二进制文件（用于032bit (pc032), 下载*win32.whl)

• 在.whl的下载dir中打开一个Cmd窗口（作为Administrator

  ）

• 设置R_USERenv var为当前用户名：

  set R_USER=%USERNAME%
  

• 在本地安装 .whl：

  python -m pip install rpy2‑2.9.3‑cp35‑cp35m‑win_amd64.whl
  

  Python的（二进制）dir必须在%PATH%，或者指定完整路径。
  检查[SO]：Installing pygraphviz on Windows 10 64-bit, Python 3.6 (@CristiFati's answer) (Shortcut section (close to the end)), or (referenced) [SO]: How to install Windows 10 上特定 Python 版本的包？ （@CristiFati 的回答） 有关自定义 .whl 安装的详细信息