在栅格堆栈中打开多个netCDF文件，按R中的z值进行子集化

Question

我在一个文件夹中有大约30个netCDF文件。他们每个人都是这样的：

> test
class       : RasterBrick 
dimensions  : 1680, 4320, 7257600, 8  (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution  : 0.08333333, 0.08333333  (x, y)
extent      : -180, 180, -56, 84  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
data source : /Users/maps/GCMD_5km/10-18/BS5min.nc 
names       : X4.5, X9.10000038146973, X16.6000003814697, X28.8999996185303, X49.2999992370605, X82.9000015258789, X138.300003051758, X229.600006103516 
centimeter  : 4.5, 9.10000038146973, 16.6000003814697, 28.8999996185303, 49.2999992370605, 82.9000015258789, 138.300003051758, 229.600006103516 
varname     : BS 

如您所见，有一个“厘米”部分表示每个文件中包含的不同层的深度。

我想在栅格中堆叠所有.nc文件，以便稍后提取几个点的值。我只对第一个深度层“4.5”感兴趣。我试过这个，希望只为每个.nc文件选择第一个深度层：

filenames <- list.files(path="~/OneDrive/OneDrive - Universitat Autònoma de Barcelona/IIASA/maps/GCMD_5km/10-18/",
                        pattern='*.nc',full.names=TRUE)
soils <- raster::brick(filenames, lvar=4, level=1)

但这将返回所有图层（带有其他警告消息）。

有什么帮助吗？谢谢

Answer 1

如果不访问您的数据，我无法证实这一点，但也许这样的事情对您有用：

soils <- lapply(filenames, raster::raster, lvar=4, level=1)
raster::brick(soils)

Answer 2

不test[[1]]，raster(test, 1)返回第一层？

raster(filename)也应该这样做。