创建Clickhouse数据库并使用R加载很多表

Question

我正在尝试创建Clickhouse数据库并将许多文件中的值复制到表中（所有文件都等于列顺序）。>>

但是我不知道如何处理。

我正在使用RClickhouse，与clickhouse-r相比，我不知道是否有任何区别。

library(RClickhouse)
library(DBI)
library(tidyverse)

eggnog_dir <- "/home/acpguedes/projects/sig_trans/data/eggnog/table/"
setwd(eggnog_dir)

myconn <- DBI::dbConnect(drv = RClickhouse::clickhouse())

mytables <- list.files(".") # all tables are in the same folder 

mysqltb <- db_create_table(con = myconn, table = 'eggnog')


lapply(mytables, function(x) {
  read_tsv(file = x, 
           col_names = c( #in my case the tables has no header
             'sequence',
             'model',
             'start',
             'end',
             'evalue',
             'cov',
             'qstart',
             'qend',
             'iteration',
             'score',
             'talilen',
             'qlen',
             'estart',
             'eend',
             'program'
             )
           ) %>% dbWriteTable(conn=myconn, value = ., name = "domains", append=TRUE) 
  }
    ) -> dt
与列本身无关，我只想作为一个示例，说明如何创建表并将许多文件（如tsv ou CSV或任何delim的表）的内容加载到表中。

我也尝试使用dbpĺyr代替copy_to()来使用dbWriteTable。

而且，在重载所有表之后，我是否应该执行'commit'语句以将数据库永久保存到R或其他平台的后继访问？

提前感谢。

我正在尝试创建Clickhouse数据库，并将许多文件中的值复制到表中（所有文件都等于列顺序）。但是我不知道如何处理。我正在使用RClickhouse，但我没有...

Answer 1

鉴于您无法在R之外或重新启动后读取该表，这听起来像是该问题正在提交给数据库。