在Raku中每n行需要阅读文本文件的建议

Question

我正在寻找有关如何在Raku / perl6中按第n个文件读取文本文件的建议。

在生物信息学研究中，有时我们需要以比直接方式少的方式来解析文本文件。例如Fastq文件，一次以4行为一组存储数据。甚至更多，这些Fastq文件成对出现。因此，如果我们需要解析此类文件，则可能需要执行以下操作：从第一个Fastq文件读取4行，从第二个Fastq文件读取4行，然后从第一个Fastq文件读取接下来的4行，然后读取第二个fastq文件中的下4行，...

关于解决此问题的最佳方法是什么，我有什么建议？ Raku的“ IO.lines”方法似乎能够一次处理每一行。但不确定如何处理每第n行

fastq文件对示例：https://github.com/wtwt5237/perl6-for-bioinformatics/tree/master/Come%20on%2C%20sister/fastq我们之前使用“ IO.lines”尝试过的操作：https://github.com/wtwt5237/perl6-for-bioinformatics/blob/master/Come%20on%2C%20sister/script/benchmark2.p6

Answer 1

[使用C0和C0可以轻松地一次从2个文件中读取4行并将它们处理为一件事情]]

zip
这将继续产生，直到至少一个文件被完全处理。 batch的替代值是my @filenames = <file1 file2>;
for zip @filenames.map: *.IO.lines.batch(4) {
    # expect ((a,b,c,d),(e,f,g,h))
}
：当两个文件完全填满4行时，它将继续进行。完成循环的其他方法是也用batch指定rotor标志，并用:partial代替rotor。 YMMV。

Answer 2

您可以使用roundrobin方法。 Raku zip很懒。这意味着对lines之类的表达式进行迭代只会将一行读入内存，而不会读取整个文件。为了进行后者，您需要将Sequence分配给"somefile".IO.lines。