如何使用样本函数将数据拆分为训练/测试集

问题描述 投票:132回答:22

我刚刚开始使用R,我不知道如何将我的数据集与以下示例代码合并:

sample(x, size, replace = FALSE, prob = NULL)

我有一个数据集,我需要进行培训(75%)和测试(25%)设置。我不确定我应该把什么信息放入x和大小? x是数据集文件,并确定了我有多少个样本?

r sample
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有许多方法可以实现数据分区。有关更完整的方法,请查看createDataPartition包中的caret函数。

这是一个简单的例子:

data(mtcars)

## 75% of the sample size
smp_size <- floor(0.75 * nrow(mtcars))

## set the seed to make your partition reproducible
set.seed(123)
train_ind <- sample(seq_len(nrow(mtcars)), size = smp_size)

train <- mtcars[train_ind, ]
test <- mtcars[-train_ind, ]

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我的解决方案将行排空,然后将前75%的行作为列,将最后的25%作为测试。超级简单!

row_count <- nrow(orders_pivotted)
shuffled_rows <- sample(row_count)
train <- orders_pivotted[head(shuffled_rows,floor(row_count*0.75)),]
test <- orders_pivotted[tail(shuffled_rows,floor(row_count*0.25)),]

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scorecard包具有一个有用的功能,您可以在其中指定比率和种子

library(scorecard)

dt_list <- split_df(mtcars, ratio = 0.75, seed = 66)

测试和训练数据存储在列表中,可以通过调用dt_list$traindt_list$test来访问


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在一个函数下面创建一个相同大小的list子样本,这个子样本不是你想要的,但可能对其他人有用。在我的例子中,在较小的样本上创建多个分类树来测试过度拟合:

df_split <- function (df, number){
  sizedf      <- length(df[,1])
  bound       <- sizedf/number
  list        <- list() 
  for (i in 1:number){
    list[i] <- list(df[((i*bound+1)-bound):(i*bound),])
  }
  return(list)
}

示例:

x <- matrix(c(1:10), ncol=1)
x
# [,1]
# [1,]    1
# [2,]    2
# [3,]    3
# [4,]    4
# [5,]    5
# [6,]    6
# [7,]    7
# [8,]    8
# [9,]    9
#[10,]   10

x.split <- df_split(x,5)
x.split
# [[1]]
# [1] 1 2

# [[2]]
# [1] 3 4

# [[3]]
# [1] 5 6

# [[4]]
# [1] 7 8

# [[5]]
# [1] 9 10

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在R示例代码中使用caTools包将如下: -

data
split = sample.split(data$DependentcoloumnName, SplitRatio = 0.6)
training_set = subset(data, split == TRUE)
test_set = subset(data, split == FALSE)

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使用基数R.函数runif生成从0到1的均匀分布值。通过变化的截止值(下面的示例中的train.size),您将始终在截止值以下具有大致相同百分比的随机记录。

data(mtcars)
set.seed(123)

#desired proportion of records in training set
train.size<-.7
#true/false vector of values above/below the cutoff above
train.ind<-runif(nrow(mtcars))<train.size

#train
train.df<-mtcars[train.ind,]


#test
test.df<-mtcars[!train.ind,]

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我建议使用rsample包:

# choosing 75% of the data to be the training data
data_split <- initial_split(data, prop = .75)
# extracting training data and test data as two seperate dataframes
data_train <- training(data_split)
data_test  <- testing(data_split)

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require(caTools)

set.seed(101)            #This is used to create same samples everytime

split1=sample.split(data$anycol,SplitRatio=2/3)

train=subset(data,split1==TRUE)

test=subset(data,split1==FALSE)

sample.split()函数将向数据帧添加一个额外的列'split1',其中2/3的行将此值设为TRUE,其他行为FALSE.Now split1为TRUE的行将被复制到train中,其他行将被复制到测试数据帧。


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假设df是您的数据框,并且您想要创建75%的列车和25%的测试

all <- 1:nrow(df)
train_i <- sort(sample(all, round(nrow(df)*0.75,digits = 0),replace=FALSE))
test_i <- all[-train_i]

然后创建一个列车并测试数据帧

df_train <- df[train_i,]
df_test <- df[test_i,]

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在查看了此处发布的所有不同方法后,我没有看到任何人使用TRUE/FALSE来选择和取消选择数据。所以我想我会分享一种利用这种技术的方法。

n = nrow(dataset)
split = sample(c(TRUE, FALSE), n, replace=TRUE, prob=c(0.75, 0.25))

training = dataset[split, ]
testing = dataset[!split, ]

Explanation

从R中选择数据有多种方式,最常见的是人们分别使用正/负指数来选择/取消选择。但是,使用TRUE/FALSE选择/取消选择可以实现相同的功能。

请考虑以下示例。

# let's explore ways to select every other element
data = c(1, 2, 3, 4, 5)


# using positive indices to select wanted elements
data[c(1, 3, 5)]
[1] 1 3 5

# using negative indices to remove unwanted elements
data[c(-2, -4)]
[1] 1 3 5

# using booleans to select wanted elements
data[c(TRUE, FALSE, TRUE, FALSE, TRUE)]
[1] 1 3 5

# R recycles the TRUE/FALSE vector if it is not the correct dimension
data[c(TRUE, FALSE)]
[1] 1 3 5

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如果你寻找可重复的结果,请注意sample分裂。如果您的数据稍有变化,即使您使用set.seed,分割也会有所不同。例如,假设您数据中已排序的ID列表是1到10之间的所有数字。如果您只删除了一个观察值,例如4,则按位置采样会产生不同的结果,因为现在5到10个所有移动的位置。

另一种方法是使用散列函数将ID映射到一些伪随机数,然后对这些数字的mod进行采样。此样本更稳定,因为赋值现在由每个观察的散列决定,而不是由其相对位置决定。

例如:

require(openssl)  # for md5
require(data.table)  # for the demo data

set.seed(1)  # this won't help `sample`

population <- as.character(1e5:(1e6-1))  # some made up ID names

N <- 1e4  # sample size

sample1 <- data.table(id = sort(sample(population, N)))  # randomly sample N ids
sample2 <- sample1[-sample(N, 1)]  # randomly drop one observation from sample1

# samples are all but identical
sample1
sample2
nrow(merge(sample1, sample2))

[1] 9999

# row splitting yields very different test sets, even though we've set the seed
test <- sample(N-1, N/2, replace = F)

test1 <- sample1[test, .(id)]
test2 <- sample2[test, .(id)]
nrow(test1)

[1] 5000

nrow(merge(test1, test2))

[1] 2653

# to fix that, we can use some hash function to sample on the last digit

md5_bit_mod <- function(x, m = 2L) {
  # Inputs: 
  #  x: a character vector of ids
  #  m: the modulo divisor (modify for split proportions other than 50:50)
  # Output: remainders from dividing the first digit of the md5 hash of x by m
  as.integer(as.hexmode(substr(openssl::md5(x), 1, 1)) %% m)
}

# hash splitting preserves the similarity, because the assignment of test/train 
# is determined by the hash of each obs., and not by its relative location in the data
# which may change 
test1a <- sample1[md5_bit_mod(id) == 0L, .(id)]
test2a <- sample2[md5_bit_mod(id) == 0L, .(id)]
nrow(merge(test1a, test2a))

[1] 5057

nrow(test1a)

[1] 5057

样本大小不完全是5000,因为赋值是概率性的,但由于大数定律,它不应该成为大样本中的问题。

另见:http://blog.richardweiss.org/2016/12/25/hash-splits.htmlhttps://crypto.stackexchange.com/questions/20742/statistical-properties-of-hash-functions-when-calculating-modulo


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它可以通过以下方式轻松完成:

set.seed(101) # Set Seed so that same sample can be reproduced in future also
# Now Selecting 75% of data as sample from total 'n' rows of the data  
sample <- sample.int(n = nrow(data), size = floor(.75*nrow(data)), replace = F)
train <- data[sample, ]
test  <- data[-sample, ]

通过使用caTools包:

require(caTools)
set.seed(101) 
sample = sample.split(data$anycolumn, SplitRatio = .75)
train = subset(data, sample == TRUE)
test  = subset(data, sample == FALSE)

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set.seed(123)
llwork<-sample(1:length(mydata),round(0.75*length(mydata),digits=0)) 
wmydata<-mydata[llwork, ]
tmydata<-mydata[-llwork, ]

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我碰到了这个,它也可以帮助我。

set.seed(12)
data = Sonar[sample(nrow(Sonar)),]#reshufles the data
bound = floor(0.7 * nrow(data))
df_train = data[1:bound,]
df_test = data[(bound+1):nrow(data),]

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有一种非常简单的方法可以使用行索引和列的R索引来选择多行。这使您可以在给定多行的情况下清理分割数据集 - 比如说您的数据的前80%。

在R中,所有行和列都被索引,因此DataSetName [1,1]是分配给第一列和“DataSetName”的第一行的值。我可以使用[,x]和使用[,x]的列选择行

例如:如果我有一个方便地命名为“data”且100行的数据集,我可以使用查看前80行

视图(数据[1:80,])

以同样的方式,我可以使用以下选择这些行并对它们进行子集化

train = data [1:80,]

test = data [81:100,]

现在我将我的数据分成两部分而不可能重新采样。快捷方便。


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这几乎是相同的代码,但更好看

bound <- floor((nrow(df)/4)*3)         #define % of training and test set

df <- df[sample(nrow(df)), ]           #sample rows 
df.train <- df[1:bound, ]              #get training set
df.test <- df[(bound+1):nrow(df), ]    #get test set

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我会用dplyr这个,让它变得非常简单。它确实需要在您的数据集中使用id变量,这无论如何都是一个好主意,不仅用于创建集合,还用于项目期间的可跟踪性。如果不包含它,请添加它。

mtcars$id <- 1:nrow(mtcars)
train <- mtcars %>% dplyr::sample_frac(.75)
test  <- dplyr::anti_join(mtcars, train, by = 'id')

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我将把'a'分成火车(70%)和测试(30%)

    a # original data frame
    library(dplyr)
    train<-sample_frac(a, 0.7)
    sid<-as.numeric(rownames(train)) # because rownames() returns character
    test<-a[-sid,]

DONE


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library(caret)
intrain<-createDataPartition(y=sub_train$classe,p=0.7,list=FALSE)
training<-m_train[intrain,]
testing<-m_train[-intrain,]

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我的解决方案与dickoa的解决方案基本相同,但更容易理解:

data(mtcars)
n = nrow(mtcars)
trainIndex = sample(1:n, size = round(0.7*n), replace=FALSE)
train = mtcars[trainIndex ,]
test = mtcars[-trainIndex ,]

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使用awesome dplyr库只是一种更简单,更简单的方法:

library(dplyr)
set.seed(275) #to get repeatable data

data.train <- sample_frac(Default, 0.7)

train_index <- as.numeric(rownames(data.train))
data.test <- Default[-train_index, ]

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如果输入:

?sample

如果将启动帮助菜单来解释样本函数的参数含义。

我不是专家,但这里有一些代码:

data <- data.frame(matrix(rnorm(400), nrow=100))
splitdata <- split(data[1:nrow(data),],sample(rep(1:4,as.integer(nrow(data)/4))))
test <- splitdata[[1]]
train <- rbind(splitdata[[1]],splitdata[[2]],splitdata[[3]])

这将为您提供75%的火车和25%的测试。

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