无法在 Docker 内运行适用于 Python 的 Matlab SDK 模块，但本地没有问题

Question

我需要在 Python 中运行 Matlab 脚本。为了实现这一目标，我首先使用 this 文档安装了 Matlab Compiler Runtime (MCR)。然后，我使用 this 文档创建并安装 matlab 脚本的 python 模块。特别是，我使用 Matlab Compiler SDK 应用程序创建模块，然后使用

python setup.py install

安装创建的目录，

setup.py

位于生成的目录中，我可以使用以下代码在 python 中成功本地执行脚本：

import test_function

mypkg = test_function.initialize()
arg1 = 1
arg2 = 2
out1, out2 = mypkg.test_function(arg1, arg2, nargout=2)
print(out1, out2)
mypkg.terminate()

现在我想从 Docker 容器内部执行该模块。因此，我安装了 MCR 安装 zip 文件（来自此处的 Linux 64），将其解压缩并将其保存到目录

matlab_runtime

。在Dockerfile中，我复制了Matlab SDK模块的目录（

test_function

），复制了MCR安装目录（

matlab_runtime

）的目录，并尝试安装Matlab Runtime。以下是对 Dockerfile 的更改：

FROM mathworks/matlab-runtime-deps:R2023b

# other not-related commands
# ...
# other not-related commands

RUN apt-get install -y python3.9 python3-pip
COPY test_function /app/test_function
COPY matlab_runtime /app/matlab_runtime
RUN ls /app/matlab_runtime
RUN pip install setuptools
WORKDIR /app
USER root
RUN chmod +x ./matlab_runtime/install
RUN python3 test_function/setup.py install
RUN sudo -H ./matlab_runtime/install

但是我收到此错误：

failed to solve: rpc error: code = Unknown desc = process "/bin/sh -c sudo -H ./matlab_runtime/install" did not complete successfully: exit code: 42

。

我尝试在 Dockerfile 中使用

make

：

RUN apt update && apt install -y make
RUN make ./matlab_runtime/install

Docker 不会返回任何错误，但是当我在 Docker 容器内运行上面的 python 脚本时，我收到错误：

AttributeError: module 'LC_filter_for_AI' has no attribute 'initialize'

，当我使用 dir(test_function) 检查模块的方法时，我得到

['__doc__', '__file__', '__loader__', '__name__', '__package__', '__path__', '__spec__']

对于模块的本地安装，我得到了方法

['_PathInitializer', '__builtins__', '__cached__', '__doc__', '__exit_packages', '__file__', '__loader__', '__name__', '__package__', '__path__', '__spec__', '_pir', 'atexit', 'glob', 'importlib', 'initialize', 'initialize_runtime', 'os', 'pdb', 'platform', 're', 'sys', 'terminate_runtime', 'weakref']

Answer 1

我可以按如下方式解决该问题。我将我的

Dockerfile

更改为：

FROM containers.mathworks.com/matlab-runtime:r2023a

# other not-related commands
# ...
# other not-related commands

RUN apt-get install -y python3.9 python3-pip
COPY test_function /app/test_function
RUN pip install setuptools
WORKDIR /app/test_function
USER root
RUN python3 setup.py install
ENV LD_LIBRARY_PATH=/opt/matlabruntime/R2023a/runtime/glnxa64:/opt/matlabruntime/R2023a/bin/glnxa64:/opt/matlabruntime/R2023a/sys/os/glnxa64:/opt/matlabruntime/R2023a/sys/opengl/lib/glnxa64:$LD_LIBRARY_PATH
ENV AGREE_TO_MATLAB_RUNTIME_LICENSE=yes

因此，我为 Matlab Runtime 使用了预构建的官方 MATLAB 容器映像 (containers.mathworks.com/matlab-runtime:r2023a)。修改

:

之后的标签以使用不同版本的 MCR。有关更多信息，请查看 Matlab 容器的文档。在我的例子中，Matlab 运行时安装到 /opt/matlabruntime/R2023a/。因此，我相应地放置了

LD_LIBRARY_PATH

以及执行所需的所有路径，并且我必须同意 matlab 运行时许可证才能执行它。

再次运行docker容器后，就没有出现上述问题了