将DICOM文件堆叠成一个多切片系列

Question

我正在尝试将不同的DICOM文件堆叠到一个多切片系列中，以便在ITK-Snap上可视化它们。但是，我似乎无法获得正常运行的DICOM系列。

我已根据切片定位对所有文件进行了排序，并且我有许多有序的单个.dcm文件及其原始信息。我用一个单独的uid替换了他们所有的原始系列实例UID，并且他们的系列号用一个自定义系列号我设置为'999'（所以使它们属于一个系列）。所有文件的图像方向设置为[1;0;0;0;1;0]，所有文件的切片厚度设置为8 mm。然后我创建了一个信息结构数组，原始切片positionings [info(num)]。

我尝试过类似的东西：

for i=1:num %where num is the number of dicom files
k = num2str(i);
dicomwrite(imm,k,info(i),'CreateMode','Copy'); %where imm is the matrix I obtained with dicomread
end

我已经获得了一组新的dicom文件，命名为从1到num的数字，但是当我尝试在ITK-snap上打开系列时，它会遇到一个异常，说明向量太长。我可以在ITK-snap上打开单个dicom文件，但是当系列中有多个图像时，系列可视化为256x212xnum，其中num是文件数，我遇到了异常。

我究竟做错了什么？

Answer 1

你要做的是被称为Multi-frame in the DICOM standard。简而言之，您需要确保所有图像元数据仍然正确，然后指定Number of Frames (0028,0008)和Frame Increment Pointer (0028,0009)。不幸的是，关于Frame Increment Pointer标签究竟如何工作的措辞有点含糊：

多帧图像中的帧应作为逻辑序列传送。确定帧顺序的信息应由帧增量指针（0028,0009）传送的数据元素标签或标签识别。支持多帧模块的每个特定图像IOD专门用于帧增量指针（0028,0009）以识别可用作序列的属性。

即使只存在单个帧，仍然需要存在帧增量指针（0028,0009）并且至少有一个值，每个值都应指向同样存在于数据集中且具有值的属性。 。 1

希望有所帮助。