是否可以在ImageJ中做“全景多维堆栈”?

问题描述 投票:0回答:1

我正在做免疫组织化学,我有两个不同的信号,想要进行细胞计数。

我的想法是在二维(标记 1、标记 2)中使用 z 堆栈(20 帧)。对于一张图像来说,这对我来说没有问题。然而,我正在查看的区域很大,并且我想使用高放大倍率,因此我想将不同的图像组合成一个非常大的图像,该图像也在两个标记中进行 z 堆叠。

这可以吗,有什么建议吗?

另外,需要注意的是,我没有带电动载物台的共焦显微镜,只有不带电动载物台的常规落射荧光显微镜。

imagej panoramas
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只要您的图像包含大量重叠(不需要电动舞台,只需确保两个相邻图像在其边界共享一些视觉特征),您就可以使用 Fiji 附带的 Stitching 插件:

  • 插件 > 拼接 > 网格/集合拼接
  • 在第一个对话框中,选择类型:未知位置

如果不同的 z 级别和颜色通道位于单独的文件中,则在拼接之前,您可能必须先将它们组合成超堆栈(图像 > 颜色 > 合并通道...)。

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