如何在R Markdown中使用开罗PNG

Question

使用Cairo来保存R图形（see here, for example）有很多优点。例如，在保存PDF时，cairo_pdf设备正确嵌入了自定义字体。

使用cairo_pdf图形设备很容易使用基于ggplot的图形与ggsave()：

library(ggplot2)

ugly_plot <- ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
  geom_point() +
  labs(title = "Some data about cars") +
  theme_gray(base_family = "Papyrus")
ugly_plot

ggsave(ugly_plot, filename = "ugly_plot.pdf", 
       width = 4, height = 2.5, device = cairo_pdf)

使用knitr在R Markdown中使用cairo_pdf设备也很容易将dev: cairo_pdf添加到YAML前端：

---
title: "Cairo stuff"
output:
  pdf_document:
    dev: cairo_pdf
---

```{r make-ugly-plot, fig.width=4, fig.height=2.5}
library(ggplot2)

ugly_plot <- ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
  geom_point() +
  labs(title = "Some data about cars") +
  theme_gray(base_family = "Papyrus")
ugly_plot
```

从Cairo correctly deals with DPI开始，使用基于开罗的PNG也有优势。如果将具有高DPI的正常保存的PNG放入Word或PowerPoint文件中，则图形的尺寸会被夸大且不准确。如果将具有相同高DPI的基于Cairo的PNG放入Word，则尺寸正确：

使用ggsave()将ggplot输出保存为高分辨率的Cairo PNG很容易，但语法与保存为Cairo PDF略有不同。我们不是指定设备，而是指定类型：

ggsave(ugly_plot, filename = "ugly_plot.png", 
       width = 4, height = 2.5, dpi = 300, type = "cairo")

将该文件放在Word或PowerPoint中可以很好地工作，并且所有内容都在高分辨率下正确调整大小。

当编织为HTML或Word时，对尺寸的这种误解会延续到R Markdown中。在编织时让编织者使用type = "cairo"会很棒，但是在R Markdown中复制这个dpi = 300, type = "cairo"却更难。开罗图书馆包括Cairo::CairoPNG()等设备，但ggsave(..., type = "cairo")不使用此设备。它使用R的标准PNG设备，但打开了Cairo支持。

通过将dpi=300添加到块选项中，使图形高分辨率很容易，但我无法使用内置的PNG设备启用type = cairo。我尝试天真地将type: cairo添加到YAML元数据中，但毫不奇怪的是它不起作用。编织者生成的PNG不使用Cairo并且比预期的要大得多（并且在HTML和Word文档中是巨大的）。

---
title: "Cairo stuff"
output:
  html_document: 
    self_contained: no  # to see resulting figure as a file
    dev: png
    type: cairo  # this doesn't do anything
---

```{r make-ugly-plot, fig.width=5, fig.height=3.5, dpi=300}
library(ggplot2)

ugly_plot <- ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
  geom_point() +
  labs(title = "Some data about cars") +
  theme_gray(base_family = "Papyrus")
ugly_plot
```

---

总而言之，我正在寻找一种方法来使用你在knitr中从ggsave(..., filename = "blah.png", dpi = 300, type = "cairo")获得的相同输出。有没有办法做到这一点？

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title: "Something"
output:
  pdf_document:
    dev: cairo_pdf  # yay Cairo output
  html_document:  # What needs to go here?
    dev: png
    type: cairo
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Answer 1

而不是尝试在yaml标头中执行它，有条件地在设置块中执行它。

if (!knitr::is_latex_output()) {
  knitr::opts_chunk$set(dpi = 300, dev.args = list(type = "cairo"))
})

我现在已经在几个文件中使用了它。注意：我只将它用于从R命令行执行rmarkdown::render(...)的文档。