我想调用我在自己的Anaconda环境中创建的Python脚本,并希望从Matlab 2020a中调用该脚本。但是,当我尝试从Matlab激活环境时,出现错误消息:
system('conda activate *name_of_environment*')
/bin/bash: conda: command not found
我在Ubuntu 18.04机器上安装了最新版本的anaconda3(2020.02),并且按照建议,没有将conda添加到bashrc中,而是按照建议的here添加了conda.sh目录:
# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/home/michael/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
eval "$__conda_setup"
else
if [ -f "/home/michael/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
. "/home/michael/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
else
export PATH="/home/michael/anaconda3/bin:$PATH"
fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<
# export PATH="/home/michael/anaconda3/bin:$PATH" # commented out by conda initialize
#Enable conda to be called from bash
source /home/michael/anaconda3/etc/profile.d
但是,我找不到从Matlab运行conda的解释。我想念什么吗?
非常感谢,最好,
Michael
让我详细说明我的评论。
二进制是通过PATH
环境变量找到的。 conda的位置不在该变量中。因此,您应该将其添加到PATH
变量中(或在通知时取消注释该脚本)。
示例:
$ export PATH="$PATH:/home/michael/anaconda3/bin/"
$ ./yourscript.sh
但是也可能是PATH
变量没有通过system()
复制,我猜这是在新的Shell中执行脚本的。在这种情况下,应将其执行为:
system('/home/michael/anaconda3/bin/conda activate *name_of_environment*')