R将我的带有“ na”的字符串列表更改为缺少值的单词（例如：BDNA3-> NA）-如何处理？

Question

自2天以来我一直在与R奋斗，没有找到任何解决方案！

这是我的问题：

• 我有一个从一个数据帧中提取的符号列表：annotation$"SYMBOL"

• 我想将其绑定到另一个称为“矩阵”的数据框，并将其分配为行名。

• 我提取了该列，将其毫无问题地绑定了。但是，我意识到，完成此操作后，将它们更改为行名将不起作用，因为〜5000个基因/ 15000随后被更改为“ NA”

• [我意识到实际上是所有在其符号中带有“ NA”的基因被视为“缺失值”

• 我尝试更改它们as.character(annotation$"SYMBOL")，但没有改变。...

HERE：

X=as.character(annotation$"SYMBOL")

summary(X)
   Length     Class      Mode 
    16978 character character  
unique (unlist (lapply (as.character(annotation$"SYMBOL"), function (x) which (is.na (x))))) 
[1] 1
Y=na.exclude(X)
summary(Y)
   Length     Class      Mode 
     9954 character character 

U=na.exclude(annotation$"SYMBOL")
Error in `$<-.data.frame`(`*tmp*`, "SYMBOL", value = c("SCYL3", "C1orf112",  : 
  replacement has 9954 rows, data has 16978

而且我知道他们将所有基因都用NA替换为NA”。

有人知道如何进行此操作吗？

例如，当我使用“ na.omit”功能时，此图像中的11号和15号被删除...。

自2天以来我一直在与R奋斗，没有找到任何解决方案！这是我的问题：我有一个从一个数据帧中提取的符号列表：notification $“ SYMBOL”，我想将其绑定到...

Answer 1

要设置NA值，应使用代码df[df == "NA"] <- NA。我将此用于您的测试数据集并产生了预期的结果。然后，您可以使用na.omit()上的df功能删除现在设置的NA数据。我没有您的有效代码，因此我将提供您的代码外观的概要：