在C ++中使用列表有效地使用RCPP返回矩阵束

Question

我正在尝试使用RCPP返回一堆矩阵。我下面的代码效率极低。我想知道以下代码是否有效。

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::List hello( 
    const arma::rowvec& g,
    const int& n, 
    const int& p,
    const arma::mat& S,
    const arma::mat& zc,
    const arma::rowvec& dl){
  Rcpp::List ht(n);

  for(int t=0; t < n;++t){

    arma::mat hhat(p,n);
    hhat.fill(0.0);
    for(int i = 0;i < n; ++i){
      arma::mat h(p,1);
      h.fill(0.0);
      if (t > i){
        for(int u=i;u <= t; ++u){
          arma::rowvec zr = zc.rows(i,i);
          h += exp(arma::as_scalar(g*zr.t())) * (zr.t() - S.cols(u,u))*dl(u);
        }
      }
      hhat.cols(i,i) = h;
    }
    ht[t] = hhat;
  }

  // Specify list length
  Rcpp::List res(1);
  res[0] = ht;

  return(res);
}

这里是例子。

g=c(1,2.1,3.1)
n=1600
p=3
S = matrix(rnorm(4800),nrow=3,ncol=1600)
dl=runif(1600)
z=matrix(runif(4800),nrow=1600,ncol=3)
ptm=proc.time();kkk= hello(g=g,n=n,p=p,S = S,zc=z,dl = dl);proc.time()-ptm;
 user  system elapsed 
  31.25    0.00   31.30 

任何帮助将不胜感激。

跟随更新的代码。最初，我正在返回列表的列表。现在，它返回一个列表。这样可以将计算时间减少10秒。我希望可以进一步改进此代码。

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::List hello( 
    const arma::rowvec& g,
    const int& n, 
    const int& p,
    const arma::mat& S,
    const arma::mat& zc,
    const arma::rowvec& dl){
  Rcpp::List ht(n);


  for(int t=0; t < n;++t){

    arma::mat hhat(p,n);
    hhat.zeros();
    for(int i = 0;i < n; ++i){
      arma::mat h(p,1);
      // h.fill(0.0);
      h.zeros();
      if (t > i){
        for(int u=i;u <= t; ++u){
          //arma::rowvec zr = zc.rows(i,i);
          h += exp(arma::as_scalar(g*zc.row(i).t())) * (zc.row(i).t() - S.col(u))*dl(u);
        }
      }
      hhat.col(i) = h;
    }
    ht[t] = hhat;
  }

  // Specify list length
  // Rcpp::List res(1);
  // res[0] = ht;

  return(ht);
}

我正在尝试实现的公式如下。

Answer 1

您的问题标题使您认为将数据返回给R时遇到了问题。请放心，这不是问题。您可以通过调用一个返回所需大小的零矩阵的函数来轻松检查此问题：