与-e和转义符多重输入

Question

我正在尝试在压缩文件中进行多次替换，并且遇到了麻烦。

zcat PteBra.fa.align.gz | sed -e 's#Simple_repeat/Satellite/Y-chromosome#Simple_repeat/Satellite#g' -e sed 's#Unknown/Unknown/Y-chromosome#Unknown/Unknown#g' -e sed 's#DNA/DNA/TcMar#DNA/TcMar#g' -e sed 's#DNA/DNA/Crypton#DNA/Crypton#g' -e sed 's#DNA/DNA/PIF-Harbinger#DNA/PIF-Harbinger#g' -e sed 's#DNA/DNA/CMC-Chapaev-3#DNA/CMC-Chapaev-3#g' -e sed 's#SINE/SINE/RTE#SINE/RTE#g' > PteBra.fa.align.corrected

请注意，由于要替换的文本中包含/，因此我使用的是＃而不是标准的/。每个sed都可以正常工作，但将它们串在一起会产生此一致的错误：

sed: -e expression #2, char 3: unterminated `s' command

我一直在寻找解决方案，但是最后，要完成工作，所有sed都要单独完成。它需要永远，所以我想使这个选项起作用。

我已经在这里待了几个小时了，不胜感激。

我在做什么错？

谢谢。

Answer 1

您不必每次都写-e sed！ -e可以。

zcat PteBra.fa.align.gz | sed -e 's#Simple_repeat/Satellite/Y-chromosome#Simple_repeat/Satellite#g' -e 's#Unknown/Unknown/Y-chromosome#Unknown/Unknown#g' -e 's#DNA/DNA/TcMar#DNA/TcMar#g' -e 's#DNA/DNA/Crypton#DNA/Crypton#g' -e 's#DNA/DNA/PIF-Harbinger#DNA/PIF-Harbinger#g' -e 's#DNA/DNA/CMC-Chapaev-3#DNA/CMC-Chapaev-3#g' -e 's#SINE/SINE/RTE#SINE/RTE#g' > PteBra.fa.align.corrected

或者您可以在sed字符串表达式本身内部使用分号

zcat PteBra.fa.align.gz | sed -e '
s#Simple_repeat/Satellite/Y-chromosome#Simple_repeat/Satellite#g;
s#Unknown/Unknown/Y-chromosome#Unknown/Unknown#g;
s#DNA/DNA/TcMar#DNA/TcMar#g;
s#DNA/DNA/Crypton#DNA/Crypton#g;
s#DNA/DNA/PIF-Harbinger#DNA/PIF-Harbinger#g; 
s#DNA/DNA/CMC-Chapaev-3#DNA/CMC-Chapaev-3#g;
s#SINE/SINE/RTE#SINE/RTE#g
' > PteBra.fa.align.corrected