ggplot2 - 在图外注释

问题描述 投票:0回答:6

我想将样本大小值与绘图上的点相关联。我可以使用

geom_text
将数字定位在点附近,但这很混乱。将它们沿着地块的外边缘排列起来会更干净。

例如,我有:

df=data.frame(y=c("cat1","cat2","cat3"),x=c(12,10,14),n=c(5,15,20))

ggplot(df,aes(x=x,y=y,label=n))+geom_point()+geom_text(size=8,hjust=-0.5)

产生这个图: enter image description here

我更喜欢这样的东西: enter image description here

我知道我可以创建第二个图并使用

grid.arrange
(就像这篇文章),但确定 textGrobs 的间距与 y 轴对齐会很乏味。有没有更简单的方法来做到这一点?谢谢!

r annotations ggplot2
6个回答
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这对于 ggplot2 3.0.0 现在很简单,因为现在可以通过在坐标函数(例如

clip = 'off'
coord_cartesian(clip = 'off')
)中使用
coord_fixed(clip = 'off')
参数来禁用绘图中的裁剪。下面是一个例子。

    # Generate data
    df <- data.frame(y=c("cat1","cat2","cat3"),
                     x=c(12,10,14),
                     n=c(5,15,20))

    # Create the plot
    ggplot(df,aes(x=x,y=y,label=n)) +
      geom_point()+
      geom_text(x = 14.25, # Set the position of the text to always be at '14.25'
                hjust = 0,
                size = 8) +
      coord_cartesian(xlim = c(10, 14), # This focuses the x-axis on the range of interest
                      clip = 'off') +   # This keeps the labels from disappearing
      theme(plot.margin = unit(c(1,3,1,1), "lines")) # This widens the right margin


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您不需要绘制第二幅图。您可以使用

annotation_custom
将对象定位在绘图区域内部或外部的任何位置。 grobs 的定位是根据数据坐标进行的。假设“5”、“10”、“15”与“cat1”、“cat2”、“cat3”对齐,则考虑了 textGrobs 的垂直定位 - 三个 textGrobs 的 y 坐标由三个数据点的 y 坐标。默认情况下,
ggplot2
将对象剪切到绘图区域,但可以覆盖剪切。相关边际需要扩大,为暴徒腾出空间。以下(使用 ggplot2 0.9.2)给出了与第二个图类似的图:

library (ggplot2)
library(grid)

df=data.frame(y=c("cat1","cat2","cat3"),x=c(12,10,14),n=c(5,15,20))

p <- ggplot(df, aes(x,y)) + geom_point() +            # Base plot
     theme(plot.margin = unit(c(1,3,1,1), "lines"))   # Make room for the grob

for (i in 1:length(df$n))  {
p <- p + annotation_custom(
      grob = textGrob(label = df$n[i], hjust = 0, gp = gpar(cex = 1.5)),
      ymin = df$y[i],      # Vertical position of the textGrob
      ymax = df$y[i],
      xmin = 14.3,         # Note: The grobs are positioned outside the plot area
      xmax = 14.3)
 }    

# Code to override clipping
gt <- ggplot_gtable(ggplot_build(p))
gt$layout$clip[gt$layout$name == "panel"] <- "off"
grid.draw(gt)

enter image description here


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基于

grid

的更简单解决方案
require(grid)

df = data.frame(y = c("cat1", "cat2", "cat3"), x = c(12, 10, 14), n = c(5, 15, 20))

p <- ggplot(df, aes(x, y)) + geom_point() + # Base plot
theme(plot.margin = unit(c(1, 3, 1, 1), "lines"))

p

grid.text("20", x = unit(0.91, "npc"), y = unit(0.80, "npc"))
grid.text("15", x = unit(0.91, "npc"), y = unit(0.56, "npc"))
grid.text("5", x = unit(0.91, "npc"), y = unit(0.31, "npc"))

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另一种选择可以使用

annotate
中的
ggplot2
,这与使用
geom_text
几乎相同:

library(ggplot2)
df=data.frame(y=c("cat1","cat2","cat3"),x=c(12,10,14),n=c(5,15,20))
ggplot(df,aes(x=x,y=y)) + 
  geom_point() + 
  annotate("text", x = max(df$x) + 0.5, y = df$y, label = df$n, size = 8) +
  coord_cartesian(xlim = c(min(df$x), max(df$x)), clip = "off") +
  theme(plot.margin = unit(c(1,3,1,1), "lines"))

reprex 包于 2022 年 8 月 14 日创建(v2.0.1)


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这个特定示例可能是 ggh4x::guide_axis_manual

的情况
# remotes::install_github("teunbrand/ggh4x")
library(ggplot2)

df <- data.frame(y=c("cat1","cat2","cat3"), x=c(12,10,14), n=c(5,15,20))

ggplot(df, aes(x=x, y=y)) +
  geom_point() +
  guides(y.sec=ggh4x::guide_axis_manual(title = element_blank(), breaks = df$y, labels = paste0("n=",df$n)))

创建于 2023-08-24,使用 reprex v2.0.2


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另一个选项在精神上与@bschneidr的方法类似,但仅使用普通

ggplot2
,即使用所谓的辅助轴技巧,这意味着使用辅助轴或重复轴来添加注释。

但是,在离散比例的情况下,这会稍微复杂一些,因为离散比例不允许使用辅助轴。因此,我们必须首先使用例如将离散 y 轴变量转换为数字来切换到连续尺度。

as.numeric(factor(...))

library(ggplot2)

df$y_num <- as.numeric(factor(df$y))

ggplot(df, aes(x = x, y = y_num, label = n)) +
  geom_point() +
  scale_y_continuous(
    breaks = unique(df$y_num),
    labels = df$y,
    expand = c(0, .6),
    sec.axis = dup_axis(
      breaks = unique(df$y_num),
      labels = paste0("n = ", df$n)
    )
  ) +
  theme(
    axis.text.y.right = element_text(size = 8 * .pt),
    axis.ticks.y.right = element_blank(),
    axis.title.y.right = element_blank()
  )

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