Running RMarkdown report with Distill - Pandoc Failing with Error 127

Question

似乎是一个永恒的问题，但却没有答案。

设置

我在 Docker 容器中的 lambda 函数中运行 R。 Lambda 的当前内存限制是 10GB 加上 10GB 临时内存。

在我的码头，我选择我的包裹等：

ENV R_VERSION=4.0.3
RUN tar xvzf pandoc-2.17.1.1-linux-amd64.tar.gz

然后经过更多的混乱，我最终跑了：

rmarkdown::render(
  input  = report_rmd,
  params = param_list,
  output_file = output_file,
  output_dir  = output_dir,
  rmd_file    = "home.rmd"
  intermediates_dir = temporary_directory,
  envir = new.env()
)

错误

rmarkdown 完成但是当我为报告提供足够大的数据集时，它将失败并出现此错误：

pandoc document conversion failed with error 127
Duration: 71455 ms Memory Size: 10240 MB Max Memory Used: 6592 MB

持续时间和内存由我的 Lambda 实例报告。看来我有更多的内存可以使用，但一些对此错误的研究表明这是一个内存问题。

Pandoc Arg +RTS -K1m -RTS

我在 rmarkdown YAML 标头中看到了更改 pandoc 堆栈大小的建议，但我无法理解这一点。在我的本地机器上，我可以快速进行实验，所以我做了这个改变 - 预计会失败：

output: 
  distill::distill_article:
    toc: true
    toc_depth: 2
    theme: theme.css
    pandoc_args: [
      "+RTS", "-K1m",
      "-RTS"
    ]

我已经将它减少到 1m 以进行相当大的运行并且它似乎工作正常。我 can 看到变化反映在执行的命令中。

"C:/Program Files/RStudio/bin/quarto/bin/pandoc" +RTS -K512m -RTS full.knit.md --to html5 --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output full.html --lua-filter "C:\Users\thebi\Documents\R\win-library\4.1\rmarkdown\rmarkdown\lua\pagebreak.lua" --lua-filter "C:\Users\thebi\Documents\R\win-library\4.1\rmarkdown\rmarkdown\lua\latex-div.lua" --self-contained +RTS -K1m -RTS --standalone --table-of-contents

你需要滚动很远，但它就在那里！

+RTS -K1m -RTS

。奇怪的是，默认值仍然首先包括在内。

然后我将它减少到 128k，嘿，presto，我们有一个有用的（如果不相关的）错误消息：

pandoc.exe: Stack space overflow: current size 33624 bytes.
pandoc.exe: Use `+RTS -Ksize -RTS' to increase it.
Error: pandoc document conversion failed with error 2

问题：

1. 看起来我的问题是 not 与 +RTS 内存问题相关。碰巧的是，我大概可以收回 500MB 的内存。那么任何想法错误 127 是什么意思？重建我的 docker 需要将近一天的时间，所以我想对我的计划有一些信心......
2. 我的 R 和 pandoc 版本可能没问题吗？这是一个在其他地方已经成功解决的问题吗——如果是的话，我怎么能在这里用它来解决呢？