运行具有泊松族和偏移量的gam时出错

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我正在尝试在R中运行gam,我收到一条奇怪的错误消息。

一般来说,每抽取一定量的水,我有一定数量的计数,我想用这个数量来计算。我正在尝试生成一个平滑的函数,它将计数作为深度的函数拟合,从而解释了采样量的差异。

test <- structure(list(depth = c(2.5, 7.5, 12.5, 17.5, 22.5, 27.5, 32.5, 
37.5, 42.5, 47.5, 52.5, 57.5, 62.5, 67.5, 72.5, 77.5, 82.5, 87.5, 
92.5, 97.5), count = c(53323, 665, 1090, 491, 540, 514, 612, 
775, 601, 497, 295, 348, 357, 294, 292, 968, 455, 148, 155, 101
), vol = c(2119.92, 111.76, 156.64, 71.28, 77.44, 73.92, 62.48, 
78.32, 74.8, 81.84, 53.68, 80.96, 80.08, 79.2, 79.2, 77.44, 77.44, 
84.48, 73.04, 59.84)), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"
), row.names = c(NA, -20L), .Names = c("depth", "count", "vol"
))

gam(count ~ s(depth) + offset(vol), data = test, family = "poisson")
Error in if (pdev - old.pdev > div.thresh) { : missing value where TRUE/FALSE needed

知道为什么这不起作用吗?如果我摆脱了偏移量,或者如果我设置了family = "gaussian",那么函数会像预期的那样运行。

编辑:我发现了

gam(count ~ s(depth) + offset(log(vol)), data = test, family = "poisson")

确实运行了,我想我看到有人说要记录变换这些偏移变量的东西,所以也许这实际上工作正常。

r poisson gam mgcv
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你肯定需要将vol放在对数刻度上(对于这个模型)。

更一般地,偏移量在链接函数的比例上进入模型。因此,如果您的模型使用family = poisson(link = 'sqrt'),那么您希望将偏移量包含为offset(sqrt(vol))

我怀疑错误来自于假设vol值在对数标度上而初始模型拟合时可能/偏差中的一些溢出或不良值。

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