重新调整r中的调色板

Question

在R我有一个零左右的数据云，一些数据在1左右，我想“重新调整”我的热量颜色，以区分较低的数字。这必须以彩虹的方式完成，我不想要“离散的颜色”我试过在image.plot中休息，但它不起作用。

  image.plot(X,Y,as.matrix(mymatrix),col=heat.colors(800),asp=1,scale="none")

我试过了 ：

lowerbreak=seq(min(values),quantile2,len=80)
  highbreak=seq(quantile2+0.0000000001,max(values),len=20)
  break=c(lowerbreak,highbreak)
  ii <- cut(values, breaks = break, 
            include.lowest = TRUE)

  colors <- colorRampPalette(c("lightblue", "blue"))(99)[ii]

Answer 1

这是使用“壁球”库的方法。使用makecmap()，您可以指定颜色值和中断，还可以指定应使用base参数进行日志拉伸。它有点复杂，但可以为您提供精细控制。我使用它来为偏斜数据着色，我需要在“低端”中进行更多定义。

为了实现彩虹调色板，我使用了内置的“jet”颜色功能，但您可以使用任何颜色集 - 我举例说明使用“colorRampPalette”创建灰度渐变。

无论您使用什么样的坡道，都需要使用base值来优化您的数据。

install.packages("squash")
library("squash")

#choose your colour thresholds - outliers will be RED
minval=0   #lowest value to get a colour
maxval=2.0 #highest value to get a colour
n.cols=100 #how many colours do you want in your palette?
col.int=1/n.cols

#create your palette
colramp=makecmap(x=seq(minval,maxval,col.int),
                 n=n.cols,
                 breaks=prettyLog,
                 symm=F,
                 base=10,#to give ramp a log(base) stretch
                 colFn=jet,
                 col.na="red",
                 right=F,
                 include.lowest=T)

# If you don't like the colFn options in "makecmap", define your own!
#   Here's an example in greyscale; pass this to "colFn" above
user.colfn=colorRampPalette(c("black","white"))

在绘图中使用colramp的示例（假设您已经在程序中的某处创建了colramp）：

varx=1:100
vary=1:100
plot(x,y,col=colramp$colors) #colors is the 2nd vector in the colramp list

要通过例如颜色[1:20]选择特定颜色，列表中的子集（如果您尝试使用上面的示例，第一种颜色将重复5次 - 不是很有用，但您可以获得逻辑并且可以玩转） 。

在我的情况下，我有一个值网格，我想变成彩色光栅图像（即颜色映射一些连续数据）。这是使用组合矩阵的示例代码：

#create a "dummy matrix"
matx=matrix(data=c(rep(2,50),rep(0,500),rep(0.5,500),rep(1,500),rep(1.5,500)),nrow=50,ncol=41,byrow=F)

#transpose the matrix
#  the output of "savemat" is rotated 90 degrees to the left
#  so savemat(maty) will be a colorized version of (matx)
maty=t(matx)

#savemat creates an image using colramp
savemat(x=maty,
    filename="/Users/KeeganSmith/Desktop/matx.png",
    map=colramp,
    outlier="red",
    dev="png",
    do.dev.off=T)

Answer 2

使用colorRampPalette时，可以设置bias参数以强调低（或高）值。

像colorRampPalette(heat.colors(100),bias=3)这样的东西会使“斜坡”聚焦在较低的位置，帮助它们在视觉上更加明显。