我正在尝试使用 R studio 中的 RPostgreSQL 包连接到本地 postgres 13 服务器。我收到以下错误。我能够使用完全相同的代码连接到远程 postgres 9 服务器。下面的链接给了我一些线索,但没有解决问题。它建议更新我的 psql 客户端,但它是最新的。这似乎与 postgres 使用的身份验证方法有关,但我并没有真正取得任何进展。任何帮助,将不胜感激。谢谢。
更新:我已经按照以下 Adrian Klaver 的建议在 GitHub 上提出了一个问题: https://github.com/tomoakin/RPostgreSQL/issues/112
# Restart R before running
library(RPostgreSQL)
# connection to the MIMIC database
mimic <- dbConnect(
PostgreSQL(),
dbname = "mimic",
host = "localhost",
port = 5432,
user = "UN",
password = "PW"
)
这是错误
Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) :
RS-DBI driver: (could not connect postgres@localhost:5432 on dbname "mimic": authentication method 10 not supported
)
我的会话信息是……..
> sessionInfo()
R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)
Running under: macOS Catalina 10.15.7
Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/libRlapack.dylib
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] dplyr_1.0.2 RPostgreSQL_0.6-2 DBI_1.1.0 stringr_1.4.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] dbplyr_1.4.4 crayon_1.3.4 assertthat_0.2.1 R6_2.4.1 lifecycle_0.2.0
[6] magrittr_1.5 pillar_1.4.4 stringi_1.4.6 rlang_0.4.8 rstudioapi_0.11
[11] blob_1.2.1 generics_0.0.2 vctrs_0.3.4 ellipsis_0.3.1 tools_4.0.2
[16] glue_1.4.1 purrr_0.3.4 compiler_4.0.2 pkgconfig_2.0.3 tidyselect_1.1.0
[21] tibble_3.0.1
我要说的是这个
RPostgreSQL_0.6-2
.
来自最近的变更日志:
2017-06-19 Tomoaki NISHIYAMA [email protected] * 来自 postgresql-9.6.3 的新 libpq 和在 Sierra (macOS 10.12) 上生成的 Makefiles
所以它正在使用不理解
libpq
身份验证的SCRAM
(9.6.3)版本。您将需要在此处提交问题:
https://github.com/tomoakin/RPostgreSQL/issues
获取更新驱动程序的项目。
2 个对我有用的选项。
我将 pg_hba.config 文件身份验证设置从 scram 更改为 md5 并在重新启动 postgres 服务器后我能够连接。我之前实际上已经尝试过,但是我的本地服务器上有 2 个版本的 Postgres 并且愚蠢地设法改变错误的文件。
Adrian Klaver 在评论中也建议使用 RPostgres(而不是 RPostgreSQL 包)。
我怀疑 RPostgreSQL 包会按照 GitHub 问题页面中的建议及时解决这个问题。
关注这里
从源代码编译包有帮助:
转到 https://cran.r-project.org/web/packages/RPostgreSQL/index.html 并为您的平台下载二进制文件(我在 mac 上并下载了 r-release (arm64):RPostgreSQL_0.7 -5.tgz)
然后在您的终端中运行:
R CMD INSTALL RPostgreSQL_0.7-5.tgz