运行 FindNeighbors 时出错 -validationMethod(as(object, superClass)) 中的错误：未找到 Objekt 'Csparse_validate'

Question

我正在使用 R 中的 Seurat vignette 来分析转录组数据

由于此错误，我突然无法运行迄今为止运行良好的脚本：

validationMethod(as(object, superClass)) 中的错误： 找不到对象“Csparse_validate”

重新安装和/或更新许多软件包（例如 Seurat、Matrix...）不起作用，我还尝试了各种版本的 Matrix 以及不同的数据集（之前已经工作过），但没有成功

还有什么办法可以解决这个问题吗？ 预先感谢！

Answer 1

删除所有软件包，然后重新安装软件包，包括 Seurat 和二进制版本的 Matrix（v 1.5-4.1）对我有用。

我不知道这是否是原因，但在之前重新安装 Matrix v1.6-1（需要编译的源版本）的尝试中，每次尝试运行 Seurat::FindNeighbors(对象，尺寸=1:30）。