有没有办法以非图形（无视图）模式运行 Cytoscape？

Question

我正在尝试使用 Cytoscape 命令行来运行导入和导出网络的脚本，如下所示：

cytoscape.bat -S "script_for_cytoscape.txt"

该脚本可以运行并执行所需的任务，但是，Cytoscape 已显示，我们可以看到网络和 GUI。

我想将其作为后台作业运行而不显示 Cytoscape。我尝试了“-noView”选项，但它不起作用。

所以我想知道是否有办法以非图形（无视图）模式运行 Cytoscape？

提前非常感谢您！

Answer 1

不幸的是，Cytoscape 没有“无 GUI”模式，因此您需要有图形显示。我过去所做的是通过 ssh 使用 X Windows 来提供所需的显示，但通过命令脚本驱动所有内容，因此不需要交互。