WGCNA中的灰色模块是否有任何大小限制？

Question

WGCNA分析结果为我们提供了几个模块。这些模块是彩色的，也可以用数字编号。通常，数字中标记为0的灰色模块与未在任何模块中聚类的基因集相对应。我的确切问题是，它的大小有没有限制，不应超过总数据的20％，或30％或50％？

Answer 1

我在其他地方收到了答案，所以我也在这里分享。

复制自support.bioconductor.org：

从WGCNA本身的角度来看，对任何模块的大小或灰色基因的数量没有限制。最终有多少基因灰色取决于分析开始时有多少基因以及它们是如何被过滤的，分析师希望在模块定义中有多大选择 - 有些人更喜欢只有高度相关基因的更紧密的模块，其他人更喜欢为模块分配尽可能多的基因。我认为没有“正确”或“错误”的灰色基因数量，至少在不了解更多关于如何进行分析的情况下也是如此。