我正在创建一个接收三个向量的函数,使用akima对它们进行插值,并使用plot_ly()绘制它们。虽然通用代码有效,但我遇到了interp()输出的z矩阵缩放问题。
让我给你举个例子:
一些摘要统计:
> unique(x)
[1] 60 48 36 32 18 24 30 15 12 28 21 19 54 20 16 27 10 39 14 17 9 6 50 8 13
> range(x)
[1] 6 60
> unique(y)
[1] 10.00 10.50 13.50 12.50 14.00 12.00 11.00 9.00 11.50 9.25 13.00 10.25 6.50 6.75 8.25 9.50
[17] 8.00 8.85 9.75 7.90 7.00 8.60 8.75 7.50 8.90 8.50 7.49 7.40 5.50 7.60 7.25 8.35
[33] 6.00 5.00 7.75 7.35 6.30 4.50 5.75 8.40 5.60 5.90 7.74 9.90 6.20 5.80
> range(y)
[1] 4.5 14.0
> head(z)
[1] 2.877272 3.267328 3.175478 3.843326 4.809792 2.827825
> range(z)
[1] 2.316529 28.147808
我在下面实现基线功能:
labs = list(x = 'x', y = 'y', z = 'z')
mat = interp(x, y, z, duplicate = 'mean', extrap = T, xo = sort(unique(x)))
plot_ly(x = mat$x, y = mat$y, z = mat$z, type = 'surface') %>%
layout(title = title,
scene = list(xaxis = list(title = labs$x),
yaxis = list(title = labs$y),
zaxis = list(title = labs$z)))
当我运行它时,输出如下:
问题是此图片中未涵盖部分数据。例如,存在大约x> 50,y <11的相当大的数据部分,其被插值省略(因此未被绘制)。
length(x[x > 50])
[1] 304
> length(y[x > 50 & y < 11])
[1] 290
> length(z[x > 50 & y < 11])
[1] 290
我怀疑这与重复的x值有关。因此,我在interp()中配置了xo参数,以便:
mat = interp(x, y, z, duplicate = 'mean', xo = sort(unique(x)), decreasing = T)
在这种情况下,部分地绘制了先前省略的区域。它看起来如下:
尽管如此,x和y轴仍然不对应于它们各自的数据范围(尽管数据可用)。底线:如何调整函数,使曲面始终延伸到x和y的整个范围?
最好
事实证明,错误来自plot_ly()。显然,z-matrix不能直接从interp()传递到plot_ly(),因为轴会错误地传递给图形。因此,需要对内插的z矩阵进行变换。
如果组合使用这两个函数,请确保执行z的转换,如下所示:
mat = interp(x,y,z, duplicate = 'mean')
x = mat$x
y = mat$y
z = matrix(mat$z, nrow = length(mat$y), byrow = TRUE)
plot_ly(x, y ,z, type = 'surface')