在闪亮的flexdashboard上加载RBioFormats时出错

Question

我有一个使用flexdashboard的闪亮应用程序，我想继续前一段时间开始的开发过程。

这个应用程序使用Bioconductor的RBioFormats包，现在我无法启动我的应用程序。在一些试验之后，当启动具有光泽的flexdashboard时会发生这种情况。这次崩溃的责任来自于尝试在flexdashboard-shiny app上加载RBioFormats库。

另一方面，在纯闪亮的应用程序（没有flexdashboard），或纯Flexdashboard非闪亮，应用程序正确运行。我在其他脚本中使用RBioFormats，它也能正常工作。

这里我发布一个简单的崩溃示例：

---
title: "Untitled"
output: flexdashboard::flex_dashboard
runtime: shiny
---

```{r setup, include=FALSE}
library(flexdashboard)
library(RBioFormats)
```

Column
-----------------------------------------------------------------------

### Chart A

```{r}

```

这个，抛出这个错误：

会话信息：

R version 3.5.3 (2019-03-11)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Arch Linux

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/libblas.so.3.8.0
LAPACK: /usr/lib/liblapack.so.3.8.0

locale:
 [1] LC_CTYPE=es_ES.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=es_ES.UTF-8       
 [4] LC_COLLATE=es_ES.UTF-8     LC_MONETARY=es_ES.UTF-8    LC_MESSAGES=es_ES.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=es_ES.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=es_ES.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] compiler_3.5.3        htmltools_0.3.6       tools_3.5.3           flexdashboard_0.5.1.1
 [5] yaml_2.2.0            Rcpp_1.0.1            rmarkdown_1.12        knitr_1.22           
 [9] jsonlite_1.6          xfun_0.6              digest_0.6.18         evaluate_0.13        
>

Answer 1

将Java Runtime Environment从v11降级到v8可以解决问题。 Java v10产生了同样的崩溃