我正在尝试使用ggplot2中的stat_summary向线图添加误差线，但是当我面对图形时它不会起作用
我的数据：
date week year location imidacloprid block wickhami virescens sexta
1 15-May 1 2015 kinston tp 1 0 0 0
2 15-May 1 2015 kinston gh 1 0 0 0
3 15-May 1 2015 kinston utc 1 0 0 0
4 15-May 1 2015 kinston gh 2 0 0 0
5 15-May 1 2015 kinston utc 2 0 0 0
6 15-May 1 2015 kinston tp 2 0 0 0
'data.frame': 576 obs. of 9 variables:
$ date : Factor w/ 27 levels "1-Jul","12-Jun",..: 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 ...
$ week : Factor w/ 12 levels "1","2","3","4",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ year : Factor w/ 2 levels "2015","2016": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ location : Factor w/ 2 levels "kinston","rocky mount": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ imidacloprid: Factor w/ 3 levels "gh","tp","utc": 2 1 3 1 3 2 3 2 1 2 ...
$ block : Factor w/ 4 levels "1","2","3","4": 1 1 1 2 2 2 3 3 3 4 ...
$ wickhami : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ virescens : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ sexta : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
总结图形数据：
wickhami_sum = summarySE(bug_subset_final,
measurevar="wickhami",
groupvars=c("imidacloprid","week","year"))
imidacloprid week year N wickhami sd se ci
1 gh 1 2015 8 0.0000 0.0000000 0.00000000 0.0000000
2 gh 1 2016 8 0.0000 0.0000000 0.00000000 0.0000000
3 gh 2 2015 8 0.0000 0.0000000 0.00000000 0.0000000
4 gh 2 2016 8 0.0000 0.0000000 0.00000000 0.0000000
5 gh 3 2015 8 0.0000 0.0000000 0.00000000 0.0000000
6 gh 3 2016 8 0.1250 0.2314550 0.08183171 0.1935012
7 gh 4 2015 8 0.0000 0.0000000 0.00000000 0.0000000
8 gh 4 2016 8 0.5000 0.4629100 0.16366342 0.3870025
9 gh 5 2015 8 0.5000 0.3779645 0.13363062 0.3159862
下面的代码没有给我任何问题，并产生两年数据合并的线图，并通过stat_summary生成误差线
ggplot(wickhami_sum, aes(x=week, y=wickhami,linetype=imidacloprid,group=imidacloprid))+
stat_summary(fun.data=mean_se,geom="errorbar",width=.2,color="black",position=position_dodge(0.2))+
stat_summary(fun.y=mean,geom="line",position=position_dodge(0.2))
但是，当我尝试按年份对数据进行分析时（如下所示），我无法获得stat_summary来生成错误栏并获取下面的错误消息
ggplot(wickhami_sum, aes(x=week, y=wickhami,linetype=imidacloprid,group=imidacloprid))+
stat_summary(fun.y=mean,geom="line",position=position_dodge(0.2))+facet_grid(year~.)+
stat_summary(fun.data=mean_se,geom="errorbar",width=.2,color="black",position=position_dodge(0.2))
Warning message:
Removed 72 rows containing missing values (geom_errorbar).
我已经尝试扩展y轴的范围/限制以包括错误条但我仍然得到相同的警告消息并且没有错误条。我希望使用stat_summary来生成分面图的误差条，而不必再次计算标准误差。任何帮助都理解为什么faceting不允许stat_summary正常运行，或者我没有正确地做什么。
以下是我认为正在发生的事情：在无面图中每周有两行数据，但在每个面板中每周只有一行，导致标准误差计算返回NA。 stat_summary用于非语义数据，并在内部进行数据汇总。使用bug_subset_final和stat_summary，或切换到geom_errorbar继续使用wickhami_sum。详情如下。
您已预先汇总了数据，但stat_summary旨在处理原始数据并在内部计算汇总值。在您传递给ggplot的摘要数据框架wickhami_sum中，每周有两行，2015年每周一行，2016年每周一行。按周和年份的所有数据都折叠为单个摘要操作的每周和每年的行。
因此，在未考虑的情节中，stat_summary每周都有两行数据。但是在刻面的情节中，它试图从单个观察中计算标准误差，这可能会返回NA，因此没有任何东西被绘制。即使在未经过无面的绘图中，您的误差线也是根据每年的两个平均值计算出来的，这也不是您想要的。
相反，要么继续使用wickhami_sum，而不是stat_summary做：
geom_errorbar(aes(ymin = wickhami - se, ymax=wickhami + se))
或者，使用bug_subset_final使用原始数据（看起来像stat_summary）：
ggplot(bug_subset_final, aes(x=week, y=wickhami)) +
stat_summary(fun.data=mean_se, geom="errorbar)`.