错误：无法将字符串转换为float（CordZ）

Question

我试图根据CSV文件中给出的坐标从CT图像中提取结节斑块。我一直在worldcoord行得到这个错误信息：无法将字符串转换为浮点数（CordZ）。我不太清楚该怎么做。

到目前为止我有这个：

def readCSV(filename):

    def readCSV(filename): lines = []
    with open(filename, 'r') as f:
        csvreader = csv.reader(f)
        for line in csvreader:
            lines.append(line)
    return lines

    cands = readCSV(cand_path)

    for cand in cands: 
        worldCoord = np.asarray([float(cand[3]),float(cand[2]),float(cand[1])])
        voxelCoord = worldToVoxelCoord(worldCoord, numpyOrigin, numpySpacing)
        voxelWidth = 65
        patch = numpyImage[voxelCoord[0],voxelCoord[1]-voxelWidth/2:voxelCoord[1]+voxelWidth/2,voxelCoord[2]-voxelWidth/2:voxelCoord[2]+voxelWidth/2]
        patch = normalizePlanes(patch)
        print ('data')
        print (worldCoord)
        print (voxelCoord)

Answer 1

我还必须指定CSV文件的行号。所以我做了：

for cand in cands[1:]

Answer 2

“只有整数，切片（:)，省略号（...），numpy.newaxis（无）和整数或布尔数组的解决方案是有效索引”

更改，

patch = numpyImage [voxelCoord[0],voxelCoord[1]- voxelWidth/2:voxelCoord[1]+voxelWidth/2,voxelCoord[2]-voxelWidth/2:voxelCoord[2]+voxelWidth/2]

至，

patch = numpyImage [int(voxelCoord[0]),int(voxelCoord[1])- int(voxelWidth/2):int(voxelCoord[1])+int(voxelWidth/2),int(voxelCoord[2])-int(voxelWidth/2):int(voxelCoord[2])+int(voxelWidth/2)]