对分组数据反复执行ANOVA（使用ezANOVA）

Question

创建样本数据：

norm_power <- rnorm(2298) 
phoneme <- c("t", "v", "s", "p")
intensity <- c("loud", "soft")
unique_ID <- as.factor(rep(c("elec1", "elec2", "elec3", "elec4", "elec5", "elec6", "elec7",
                   "elec8", "elec9", "elec10"), length.out = 2298))

Subject <- as.factor(rep(c("DBS1", "DBS2", "DBS3", "DBS4"), length.out = 2298))    
sample_data <- data.frame(norm_power, unique_ID, Subject, stringsAsFactors = FALSE)    
sample_data$intensity[sample(1:nrow(sample_data), nrow(sample_data), FALSE)] <- rep(intensity, c(1149,1149))    
sample_data$phoneme[sample(1:nrow(sample_data), nrow(sample_data), FALSE)] <- rep(phoneme, c(574, 574, 575, 575))

我正在尝试执行方差分析并提取样本数据的多个子集的系数-参见上文。当我将数据集过滤到单独的电极（即“ elec1”）中时，我可以获得结果（请参见输出）：

sample_data_elec1 <- filter(sample_data, unique_ID == "elec1")

output <-ezANOVA(dv = norm_power, within=.(phoneme, intensity), wid=Subject, data=sample_data_elec1)

但是，当我尝试一次对sample_data的多个“子集”完成类似的操作时，我只会为所有操作生成NA。请参阅下面的“ anova_data”：

get_coefs <-function(d){

  output <-ezANOVA(dv = norm_power, within=.(phoneme, intensity), wid=Subject, data=d)

  tibble('phoneme_F' = output[["ANOVA"]][[4]][1], "phoneme_pval" = output[["ANOVA"]][[5]][1], 
         "intensity_F" = output[["ANOVA"]][[4]][2], "intensity_pval" = output[["ANOVA"]][[5]][2], 
         "interact_F" = output[["ANOVA"]][[4]][3], "interact_pval"= output[["ANOVA"]][[5]][3])
}

anova_data <- sample_data %>% 
  group_by(unique_ID) %>% 
  do({get_coefs(.)}) %>% 
  ungroup()

感谢您的帮助-如果可以进一步说明，请告诉我！

Answer 1

您收到错误，因为您正在运行重复测量方差分析的测试。使用this website中的示例，它具有非常严格的设计：

library(ez)
bilingual=read.delim("http://coltekin.net/cagri/R/data/bilingual.txt")
# this works
ezANOVA(data=bilingual,dv=mlu,wid=.(subj),
within=.(language, age), between=gender)
并且您可以看到，对于每个主题，本质上每个元素之前/之后或它们的组合都只有一个测量值。

table(bilingual$age,bilingual$language,bilingual$subj)

, ,  = 1


              home.only school
  firstgrade          1      1
  preschool           1      1
  secondgrade         1      1

, ,  = 2


              home.only school
  firstgrade          1      1
  preschool           1      1
  secondgrade         1      1
返回到示例，您需要使用within_full，因为您有多个度量，某些示例数据集可以使用，但是您会看到一些抱怨，这是正确的，因为设计并不意味着对于此测试：

output <-ezANOVA(dv = norm_power,between=.(phoneme, intensity), within_full=.(phoneme, intensity), wid=.(Subject), data=droplevels(sample_data_elec1))
而且您也错过了之间的影响，根据反复测量，我已经在上面为您补充了这些影响。现在，如果您的研究或测试不适合repeated measure anova，则只需将要测试的所有变量放在以下之间：

output <-ezANOVA(dv = norm_power,between=.(phoneme, intensity), wid=.(Subject), data=droplevels(sample_data_elec1))