C＃-读取文件的特定部分并将每一行拆分为数组或列表

Question

首先，大家好。我是C＃的初学者，正在尝试做此作业。我的问题是，读取.pdb（蛋白质数据库）文件的特定部分并将该特定行拆分为数组或列表。然后我将其用于Forms App

所以.pdb文件索引看起来像这样；

标头防冻17-SEP-97 7MSI标题III型抗冻蛋白ISOFORM HPLC 12COMPND MOL_ID：1；化合物2分子：III型抗冻蛋白ISOFORM HPLC 12；来源MOL_ID：1；消息来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC：美洲巨;；原子1 N MET A 0 18.112 24.345 32.146 1.00 51.10 N原子2 CA MET A 0 18.302 23.436 31.020 1.00 49.06 C原子3 C MET A 0 18.079 24.312 29.799 1.00 46.75 C原子4 O MET A 0 16.928 24.678 29.560 1.00 48.24 O原子5 CB MET A 0 17.257 22.311 31.008 1.00 48.14 C原子6 N ALA A 1 19.106 24.757 29.076 1.00 43.47 NHETATM 491 O OH A 101 23.505 19.335 23.451 1.00 35.56 OHETATM 492 O HOH A 102 19.193 19.013 25.418 1.00 12.73 OHETATM 493 O HOH A 103 7.781 12.538 12.927 1.00 80.11 O

....并继续这样

我只需要阅读以“ ATOM”关键字开头的行。然后，我想将它们的信息拆分为变量以及数组或列表。之后，我想将X坐标的最大值打印到标签。

例如；

原子1 N MET A 0 18.112 24.345 32.146 1.00 51.10 N

1代表原子序数

N代表原子名称

MET代表氨基酸名称

18.112代表X坐标等。

我要做什么

我使用了之前在这里提出的类似问题的代码，但无法将其实现到我的项目中。首先，我为变量创建了一个类[]

class Atom
{
    public int atom_no;
    public string atom_name;
    public string amino_name;
    public char chain;
    public int amino_no;
    public float x_coordinate;
    public float y_coordinate;
    public float z_coordinate;
    public float ratio;
    public float temperature;
}
对于主要阶层；注意：我应该提到变量之间没有单个空格。例如，在“ MET”和“ A”之间，存在额外的3或4个空格。我尝试在读取文件时将其删除，但是不知道是否可行。.

     private void button1_Click(object sender, EventArgs e)
        {
            string filePath = @"path_of_file";
            string stringToSearch = @"ATOM";


      List<Atom> Atoms = new List<Atom>();
      using (StreamReader sr = new StreamReader(filePath))
          {
          string[] lines = File.ReadAllLines(filePath);

             foreach (string line in lines)
             {
             if (line.Contains(stringToSearch))   // i have tried to read the parts that starts with ATOM
             {
               while (sr.Peek() >= 0)   //this while part is from the question asked before
               {
                   string[] strArray;
                   string line1 = sr.ReadLine();               // i've added theese 2 lines to remove the extra whitespaces 
                   var lineParts = line1.Split(" ".ToCharArray(), StringSplitOptions.RemoveEmptyEntries);

                    strArray = line1.Split(' ');
                    Atom currentAtom = new Atom();
                    currentAtom.atom_no = int.Parse(strArray[0]);
                    currentAtom.atom_name = strArray[1];
                    currentAtom.amino_name = strArray[2];
                    currentAtom.chain = char.Parse(strArray[3]);
                    currentAtom.amino_no = int.Parse(strArray[4]);
                    currentAtom.x_coordinate = float.Parse(strArray[5]);
                    currentAtom.y_coordinate = float.Parse(strArray[6]);
                    currentAtom.z_coordinate = float.Parse(strArray[7]);
                    currentAtom.ratio = float.Parse(strArray[8]);
                    currentAtom.temperature = float.Parse(strArray[9]);

                    Atoms.Add(currentAtom);

                }

             }
         }


      }
      listBox1.DataSource = Atoms;
      listBox1.ValueMember = "atom_no";
      listBox1.DisplayMember = "atom_name";

}

我尚未将要打印X坐标最大值的部分添加到标签。我现在正在使用列表框进行测试。因此，当我运行代码并按下按钮时，在currentAtom.atom_no = int.Parse(strArray[0]);行上显示“输入字符串的格式不正确”错误。 

[我知道我的代码看起来一团糟，如果我偷了你的时间，对不起。如果你们能帮助我为我的作业做这个表格应用程序，我将不胜感激。如果没有，仍然感谢您阅读。祝您健康愉快。.>

首先，大家好。我是C＃的初学者，正在尝试做此作业。我的问题是，读取.pdb（蛋白质数据库）文件的特定部分，并将该特定行拆分为...

Answer 1

一种方法是只使用File.ReadAllLines来读取文件，然后过滤掉没有StartWith stringToSearch文本的任何行（使用System.Linq方法Where），最后使用Atom方法从每一行中选择一个新的Split（并删除空条目），最后使用ToList将它们全部返回：

List<Atom> Atoms = File.ReadAllLines(filePath)       // Read all the lines
    .Where(line => line.StartsWith(stringToSearch))  // Filter on our string
    .Select(line =>
    {
        // Split the line on the space character into an array 
        var strArray = line.Split(new[] {' '}, StringSplitOptions.RemoveEmptyEntries);

        // Return a new Atom for each line based on the array contents
        return strArray.Length < 10  // Ensure we have at least ten elements in the array
            ? null                   // If we don't have 10, return 'null'
            : new Atom               // Otherwise return a new atom from the array
            {
                atom_no = int.Parse(strArray[0]),
                atom_name = strArray[1],
                amino_name = strArray[2],
                chain = char.Parse(strArray[3]),
                amino_no = int.Parse(strArray[4]),
                x_coordinate = float.Parse(strArray[5]),
                y_coordinate = float.Parse(strArray[6]),
                z_coordinate = float.Parse(strArray[7]),
                ratio = float.Parse(strArray[8]),
                temperature = float.Parse(strArray[9])
            };
    })
    .ToList();                       // Return the items as a list