如何在pROC中的multiclass.roc图中添加标题?

问题描述 投票:1回答:1

我有一个由5个类别的nnet:multinom构成的26个变量的多项式模型:

mirna_multinom_0 = multinom(formula_0, data= clase_training, maxit=10000 )

然后,我使用以下命令创建ROCS:

multiclass.roc(clase_training$clase, mirna_multinom_0$fitted.values,plot=TRUE)

我要绘图。

pred_test_inter_multinom_5 = predict(interaction_multinom_model_5, newdata = clase_test, "probs")
multiclass.roc(clase_test$clase, pred_test_inter_multinom_5,plot=TRUE)

Plot of first contrast Ctrl vs Group1

为了理解它们,我将其存储为对象e,并将对比度称为names(e$roc)以查看我的对比度。

e = multiclass.roc(clase_training$clase, mirna_multinom_0$fitted.values)
names(e$rocs)

 [1] "Control/Idiop_grave"      "Control/Idiop_leve"       "Control/Isquem_grave"    
 [4] "Control/Isquem_leve"      "Idiop_grave/Idiop_leve"   "Idiop_grave/Isquem_grave"
 [7] "Idiop_grave/Isquem_leve"  "Idiop_leve/Isquem_grave"  "Idiop_leve/Isquem_leve"  
[10] "Isquem_grave/Isquem_leve"

哪个给了我2个图,一个在>方向,另一个在

现在。 我能以某种方式在绘图中绘制每个对比的标题吗?

而且,是否有一种方法可以针对每个ROC对比度获取曲线AUC下的面积?我仅在针对多项式的消息中获取它。 Wich没有PROC图。 我能否获得多项式ROC,或者仅是其无图形表示的构造?

r roc multinomial nnet proc-r-package
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我是否可以以某种方式在图中绘制每个对比的标题?

您将需要自己遍历曲线,但是可以轻松完成,例如:

for (contrast in names(e$rocs)) {
    plot(e$rocs[[contrast]][[1]], col = "green", main = contrast)
    plot(e$rocs[[contrast]][[2]], col = "blue", add = TRUE)
}

有没有一种方法可以获取每个ROC对比度的曲线AUC下的面积?

您可以使用auc功能执行类似的操作:

for (contrast in names(e$rocs)) {
    print(contrast)
    print(auc(e$rocs[[contrast]][[1]]))
    print(auc(e$rocs[[contrast]][[2]]))
}

我可以获取多项式ROC,还是仅获取没有图形表示的构造?

[Hand&Till在doi:10.1023/A:1010920819831中描述的一种AUC平均值。没有相应的曲线可表示。

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