无法在 Python 中以编辑模式打开 netCDF 文件

Question

我正在尝试使用 netCDF4 库在 Python 中以编辑模式打开 netCDF 文件。我收到的错误是这样的：

OSError: [Errno -101] NetCDF: HDF error: b'example.nc'

操作系统：Ubuntu 22:04 IDE：VS 代码 还值得注意的是，我在 VS Code 中使用了 Jupyter。 我的代码：

import netCDF4 as nc
import h5py
import os
os.getcwd()
file = 'example.nc'
dataset = nc.Dataset(file, 'r+')

完整错误：

OSError                                   Traceback (most recent call last)
Cell In[3], line 6
      4 os.getcwd()
      5 file = 'example.nc'
----> 6 dataset = nc.Dataset(file, 'r+') # Open the netCDF file in read mode
      7 print(dataset)

File src/netCDF4/_netCDF4.pyx:2463, in netCDF4._netCDF4.Dataset.__init__()

File src/netCDF4/_netCDF4.pyx:2026, in netCDF4._netCDF4._ensure_nc_success()

OSError: [Errno -101] NetCDF: HDF error: b'example.nc'

我已经检查过该文件是否具有读写权限，并且确实具有。所以这可能不是问题。

Answer 1

如果您尝试打开一个文件进行读写（使用

OSError: [Errno -101] NetCDF: HDF error

），则可能会出现错误

r+

，但您只能读取该文件。

要解决此问题：

• 如果您只需要读取文件，则使用

  r

  而不是

  r+

  。
• 如果您需要就地编辑文件，请在使用

  chmod 755 myfile.nc

  打开文件之前更改权限（在 Linux 上使用类似

  r+

  的内容）。
• 如果您无法更改权限，您可能想尝试使用 xarray 而不是 netcdf4-python。