编辑说明： 这个问题最初表述为
如何在 Linux 中将 SimpleITK.Show() 链接到 imageJ？
通过将 SimpleITK 1.0.0 升级到 1.0.1，我能够从 SimpleITK.Show() 启动 ImageJ。但是，ImageJ 无法打开“sample_mri.hdr”。 ImageJ 生成以下错误消息。
文件格式不受支持，读者
插件不可用，或者找不到。
root/local/linux/ImageJ/open("/temp/TempFile-7131-2.nii");
root/local/linux/ImageJ/rename("/temp/TempFile-7131-2.nii");
我已经为 ImageJ 安装了合适的插件来读取 hdr/img（分析格式）。我可以通过转到文件>打开
直接从ImageJ打开“sample_mri.hdr”调试信息：
sitk.Show(img, 'sample image', debugOn=True)
FindApplication搜索路径：[ ./Fiji.app, /cis/home/vwang/bin/Fiji.app, ~/bin/Fiji.app, /opt/Fiji.app, /usr/local/Fiji.app ]
结果：
FindApplication搜索路径：[ ./Fiji.app, /cis/home/vwang/bin/Fiji.app, ~/bin/Fiji.app, /opt/Fiji.app, /usr/local/Fiji.app ]
结果：
FindApplication搜索路径：[ ./ImageJ, /cis/home/vwang/bin/ImageJ, ~/bin/ImageJ, /opt/ImageJ, /usr/local/ImageJ ]
结果：
FindApplication搜索路径：[ ./, /cis/home/vwang/bin/, ~/bin/, /opt/, /usr/local/ ]
结果：/usr/local/bin/ImageJ
显示命令：'/usr/local/bin/ImageJ' '-e' 'open("/tmp/sample-4434-0.nii");重命名（“样品”）;'
插件：
如何在 Linux 中将 SimpleITK.Show() 链接到 imageJ？
我已经下载了ImageJ，直接运行ImageJ就可以查看图片了。过去曾提出并回答过类似的问题（不能“链接”SimpleITK::Show() 与 FIJI），但解决方案是针对 windows 操作系统的。
的 unix 等价物是什么setx SITK_SHOW_COMMAND "C:\blah\blah\ImageJ\ImageJ.exe
我的python代码：
import SimpleITK as sitk
img = sitk.ReadImage("sample_mri.hdr")
sitk.Show(img, 'sample image')
错误信息：
return _SimpleITK.Show(*args, **kwargs)
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK Show:
/tmp/SimpleITK/Code/IO/src/sitkShow.cxx:500:
sitk::ERROR: Error in administrating child process: [No such file or directory]
在 Ubuntu 上，我遇到了完全相同的问题，这是解决方案：
fiji 将包含显示 mri 文件所需的所有插件，例如 nifti 和 mha
SimpleITK 无法找到 ImageJ。尝试将 debugOn=True 参数添加到 Show 命令。这将向您显示它用于尝试查找 ImageJ 的搜索路径。
所以你的节目如下：
sitk.Show(img, 'sample image', debugOn=True)
在 Linux 系统上，SimpleITK 会搜索以下选项的路径：Fiji.app/ImageJ-linux64、Fiji.app/ImageJ-linux32、ImageJ/imagej、ImageJ 和 imagej。
如果您的 ImageJ 可执行文件被命名为其他名称，SimpleITK 将找不到它。我建议使用软链接使其可找到，或者使用 SITK_SHOW_COMMAND 环境变量。
更新：找不到 ImageJ 是您最初的问题。我不确定你的更新，但是设置了 debugOn 标志，你可以看到 SimpleITK 用来尝试启动 ImageJ 的实际命令行。
在 Ubuntu 上，我执行了以下操作并且有效：
unzip Fiji-download.zip -d ~/.export SITK_SHOW_COMMAND="$HOME/Fiji.app/ImageJ-linux64"SimpleITK 应该在没有它的情况下找到 ImageJ，因为它位于预期的位置，但只需尝试一下，看看它是否有效。