如何在没有 UDF 的情况下计算 PySpark 数据帧中数组列中的尾随零数

问题描述 投票:0回答:5

我有一个数据框,其中有一列具有固定数量的整数的数组。 如何向 df 添加包含数组中尾随零数量的列? 我想避免使用 UDF 以获得更好的性能。

例如输入df:

>>> df.show()
+------------+
|           A|
+------------+
| [1,0,1,0,0]|
| [2,3,4,5,6]|
| [0,0,0,0,0]|
| [1,2,3,4,0]|
+------------+

和想要的输出:

>>> trailing_zeros(df).show()
+------------+-----------------+
|           A|   trailingZeros|
+------------+-----------------+
| [1,0,1,0,0]|                2|
| [2,3,4,5,6]|                0|
| [0,0,0,0,0]|                5|
| [1,2,3,4,0]|                1|
+------------+-----------------+
python apache-spark pyspark apache-spark-sql
5个回答
5
投票

将数组转换为字符串时,有几种新方法可以获取结果:

>>> from pyspark.sql.functions import length, regexp_extract, array_join, reverse
>>> 
>>> df = spark.createDataFrame([(1, [1, 2, 3]),
...                             (2, [2, 0]),
...                             (3, [0, 2, 3, 10]),
...                             (4, [0, 2, 3, 10, 0]),
...                             (5, [0, 1, 0, 0, 0]),
...                             (6, [0, 0, 0]),
...                             (7, [0, ]),
...                             (8, [10, ]),
...                             (9, [100, ]),
...                             (10, [0, 100, ]),
...                             (11, [])],
...                            schema=("id", "arr"))
>>> 
>>> 
>>> df.withColumn("trailing_zero_count",
...               length(regexp_extract(array_join(reverse(df.arr), ""), "^(0+)", 0))
...               ).show()
+---+----------------+-------------------+
| id|             arr|trailing_zero_count|
+---+----------------+-------------------+
|  1|       [1, 2, 3]|                  0|
|  2|          [2, 0]|                  1|
|  3|   [0, 2, 3, 10]|                  0|
|  4|[0, 2, 3, 10, 0]|                  1|
|  5| [0, 1, 0, 0, 0]|                  3|
|  6|       [0, 0, 0]|                  3|
|  7|             [0]|                  1|
|  8|            [10]|                  0|
|  9|           [100]|                  0|
| 10|        [0, 100]|                  0|
| 11|              []|                  0|
+---+----------------+-------------------+

4
投票

从 Spark 2.4 开始,您可以使用高阶函数

AGGREGATE
来做到这一点:

from pyspark.sql.functions import reverse

(
  df.withColumn("arr_rev", reverse("A"))
  .selectExpr(
    "arr_rev", 
    "AGGREGATE(arr_rev, (1 AS p, CAST(0 AS LONG) AS sum), (buffer, value) -> (if(value != 0, 0, buffer.p), if(value=0, buffer.sum + buffer.p, buffer.sum)), buffer -> buffer.sum) AS result"
  )
)

假设

A
是您的数字数组。这里只是要小心数据类型。我将初始值转换为
LONG
假设数组内的数字也是长整型。


3
投票

对于 Spark 2.4+,您绝对应该使用

aggregate
,如 @David Vrba 已接受的 answer 所示。

对于较旧的模型,这是正则表达式方法的替代方法。

首先创建一些示例数据:

import numpy as np
NROWS = 10
ARRAY_LENGTH = 5
np.random.seed(0)
data = [
    (np.random.randint(0, 100, x).tolist() + [0]*(ARRAY_LENGTH-x),) 
    for x in np.random.randint(0, ARRAY_LENGTH+1, NROWS)
]

df = spark.createDataFrame(data, ["myArray"])
df.show()
#+--------------------+
#|             myArray|
#+--------------------+
#| [36, 87, 70, 88, 0]|
#|[88, 12, 58, 65, 39]|
#|     [0, 0, 0, 0, 0]|
#|  [87, 46, 88, 0, 0]|
#|  [81, 37, 25, 0, 0]|
#|   [77, 72, 9, 0, 0]|
#|    [20, 0, 0, 0, 0]|
#|  [80, 69, 79, 0, 0]|
#|[47, 64, 82, 99, 88]|
#|   [49, 29, 0, 0, 0]|
#+--------------------+

现在反向迭代列,如果列是

null
,则返回
0
,否则返回
ARRAY_LENGTH-(index+1)
。合并其结果,这将从第一个非空索引返回值 - 与尾随 0 的数量相同。

from pyspark.sql.functions import coalesce, col, when, lit, 
df.withColumn(
    "trailingZeroes",
    coalesce(
        *[
            when(col('myArray').getItem(index) != 0, lit(ARRAY_LENGTH-(index+1)))
            for index in range(ARRAY_LENGTH-1, -1, -1)
        ] + [lit(ARRAY_LENGTH)]
    )
).show()
#+--------------------+--------------+
#|             myArray|trailingZeroes|
#+--------------------+--------------+
#| [36, 87, 70, 88, 0]|             1|
#|[88, 12, 58, 65, 39]|             0|
#|     [0, 0, 0, 0, 0]|             5|
#|  [87, 46, 88, 0, 0]|             2|
#|  [81, 37, 25, 0, 0]|             2|
#|   [77, 72, 9, 0, 0]|             2|
#|    [20, 0, 0, 0, 0]|             4|
#|  [80, 69, 79, 0, 0]|             2|
#|[47, 64, 82, 99, 88]|             0|
#|   [49, 29, 0, 0, 0]|             3|
#+--------------------+--------------+

1
投票

自 Spark 1.5.0 起又一个有效的解决方案。这里我们使用

trim
rtrim
regexp_replace
length
来计算尾随零:

from pyspark.sql.functions import expr

to_string_expr = expr("regexp_replace(trim('[]', string(A)), ', ', '')")

df.withColumn("str_ar", to_string_expr) \
  .withColumn("trailingZeroes", expr("length(str_ar) - length(rtrim('0', str_ar))"))

# +---------------+--------------+
# |              A|trailingZeroes|
# +---------------+--------------+
# |[1, 0, 1, 0, 0]|             2|
# |[2, 3, 4, 5, 6]|             0|
# |[0, 0, 0, 0, 0]|             5|
# |[1, 2, 3, 4, 0]|             1|
# +---------------+--------------+

分析:

expr
最里面的元素开始到最外面的元素:

  1. string(A)
    将数组转换为其字符串表示形式,即
    [1, 0, 1, 0, 0]

  2. trim('[]', string(A))
    分别删除前导
    [
    和尾随
    ]
    ,即
    1, 0, 1, 0, 0

  3. regexp_replace(trim('[]', string(A)), ', ', '')
    删除项目之间的
    ,
    以形成最终的字符串表示形式,即
    10100

  4. rtrim('0',regexp_replace(trim('[]', string(A)), ', ', ''))
    修剪尾随零,即:
    101

  5. 最后我们得到完整字符串和修剪后的字符串的长度,然后将它们相减,这将得到零尾随长度。

更新

使用下一个代码,您可以填充一些数据(借自 @pault 的帖子)并使用

timeit
测量大型数据集的执行时间。

下面我为发布的三种方法添加了一些基准测试。从结果中我们可以得出结论,这些方法的性能存在一些趋势:

from pyspark.sql.functions import expr, regexp_replace, regexp_extract, reverse, length, array_join
import numpy as np
import timeit

NROWS = 1000000
ARRAY_LENGTH = 5
np.random.seed(0)
data = [
    (np.random.randint(0, 9, x).tolist() + [0]*(ARRAY_LENGTH-x),) 
    for x in np.random.randint(0, ARRAY_LENGTH+1, NROWS)
]

df = spark.createDataFrame(data, ["A"])

def trim_func():
  to_string_expr = expr("regexp_replace(trim('[]', string(A)), ', ', '')")
  df.withColumn("str_ar", to_string_expr) \
    .withColumn("trailingZeroes", expr("length(str_ar) - length(rtrim('0', str_ar))")) \
    .show()
# Avg: 0.11089507223994588

def aggr_func():
  df.withColumn("arr_rev", reverse("A")) \
    .selectExpr("arr_rev", "AGGREGATE(arr_rev, (1 AS p, CAST(0 AS LONG) AS sum), \
                (buffer, value) -> (if(value != 0, 0, buffer.p), \
                if(value=0, buffer.sum + buffer.p, buffer.sum)), \
                buffer -> buffer.sum) AS result") \
   .show()
# Avg: 0.16555462517004343

def join_func():
  df.withColumn("trailing_zero_count", \
                length( \
                  regexp_extract( \
                    array_join(reverse(df["A"]), ""), "^(0+)", 0))) \
  .show()
# Avg:0.11372986907997984

rounds = 100
algs = {"trim_func" : trim_func, "aggr_func" : aggr_func, "join_func" : join_func}
report = list()
for k in algs:
  elapsed_time = timeit.timeit(algs[k], number=rounds) / rounds
  report.append((k, elapsed_time))

report_df = spark.createDataFrame(report, ["alg", "avg_time"]).orderBy("avg_time")
display(report_df)

结果表明,对于 1000000 行和 100 次执行的数据集,基于字符串的处理(trim_func、join_func)方法的平均执行时间降低了25%-30%

在不确定确切原因的情况下,我可以假设额外的处理时间是由于聚合函数本身的复杂性而产生的。无论如何,看起来性能差异还是相当大的。

测试在databricks社区版集群/笔记本下执行。


0
投票

使用

getItem()
以及数组中每个项目的双
when().otherwise()
,对数组进行向后迭代会构建一个由零组成的负计数器。当遇到第一个非零值时,计数器变为正值并停止计数。 reduce 以伪计数 -1 启动计数器,该伪计数在最后被删除。

import pyspark.sql.functions as F
from functools import reduce

cols = [F.col('myArray').getItem(index) for index in range(ARRAY_LENGTH-1, -1, -1)]
trailing_count_column = F.abs(reduce(lambda col1, col2: F.when((col1 < 0) & (col2 != 0), -col1).othewise(
    F.when((col1 < 0) & (col2 == 0), col1 - 1).otherwise(col1)), cols, F.lit(-1))) - 1

df = df.withColumn('trailingZeroes', trailing_count_column)
© www.soinside.com 2019 - 2024. All rights reserved.