R CMD 检查完整的检查需要“checkbashisms”脚本

Question

我正处于使用 RStudio 编写包的早期阶段。基本包结构是使用 William Landau 的

instantiate

包创建的。 当我单击

Check

按钮时，一切似乎都很顺利，但我收到两个警告，其中一个完整显示：

检查顶级文件...警告完整的检查需要 “checkbashisms”脚本。请参阅“配置和清理”部分 “编写 R 扩展”手册。

（另一个警告完全是关于其他事情的）。

我看到了这个答案：[https://stackoverflow.com/questions/63698128/r-package-check-warning-a-complete-check-needs-the-checkbashisms-script] 但还是不明白该怎么办。我不知道

$PATH

是什么，也不知道如何添加一些东西。

我还看到了这个答案： [ https://stat.ethz.ch/pipermail/r-package-devel/2020q3/005877.html][1]

因此，我将

_R_CHECK_BASHISMS_ = FALSE

添加到我的

.Renviron

文件中，但这没有效果。

我需要做什么才能删除此警告？

Answer 1

R 检查代码希望在不依赖

configure

shell 的情况下编写

cleanup

和

bash

脚本，因为它并非在可能安装了软件包的所有系统上都可用。

它使用名为

checkbashisms

的脚本来查看这些文件以确认它们是可移植编写的。但是，

checkbashisms

不包含在 R 中，它假定在您的系统上可用。因此，如果您有

configure

或

cleanup

脚本，但 R 找不到

checkbashisms

，您会收到警告。

这意味着有几种方法可以停止该消息。您可以将

checkbashisms

安装在 R 可以找到的地方。它使用

PATH

环境变量来搜索外部程序，因此您需要确保

checkbashisms

安装在其中列出的目录之一中。 （您可以在 R 中使用

Sys.getenv("PATH")

查看该环境变量。）

另一种方法是确保您的包不包含

configure

或

cleanup

脚本。这些仅适用于执行复杂操作（通常使用外部库）的包。您在评论中提到自动生成的脚本正在寻找 Stan 模型。这可能意味着您需要这些脚本。

但是，除非您的编写水平相当低，否则您的包依赖于另一个使用 Stan 的包可能就足够了，例如

RStan

。然后，如果找不到 Stan，则其他包将无法加载，您的包也将无法加载。然后您可以删除

configure

和

cleanup

并且不需要安装

checkbashisms

。