Python问题来计算连续出现的字符串的值

Question

我有一串名为seq的文本，其值如下：AATTDYAATTDUUAATTDAATTDAATTDAAAGATAGATAYAMMMCCMMMMMMMMM

现在，我还有一个存储这些字符串的值列表：['AATTD','AGAT','MMM']。我想用我的代码实现的目的是计算列表中的每个单词（不是每个字母）出现在文本连续中的次数，并将该字符串的计数值存储在字典中。

[当我连续说时，这意味着在以上文本的这一部分中，AATTDYAATTDUUAATTDAATTDAATTD，值AATD的计数应仅为3，因为其他2个分别由Y和UU分开。

到目前为止，这是我对代码所做的事情：

count = 0
list1 = ['AATTD','AGAT','MMM']
length = len(list1) # The length of the list 
print(length)

seq = open(filepath, "r") # open the file that has the string of text
seq = seq.read()

for i in range(len(seq)):
    for j in list1:
        while (seq[i:len(j)]  == len(j) ):
            if seq[i:len(j)]  == j:
                count += 1
    print (j, count)

但是这似乎将以0计数打印每个字符串。谁能帮我解决这个问题？谢谢！

Answer 1

使用re.findall的一种方法：

Answer 2

如果我正确理解期望的结果，可以通过以下方式实现：

Answer 3

在python中使用regex默认软件包。

Answer 4

实际上您可以使用count。